17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8687 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3760  Phytanoyl-CoA dioxygenase  92.17 
 
 		 346 aa  647    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8687  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 346 aa  698    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1911  phytanoyl-CoA dioxygenase  84.06 
 
 		 456 aa  525  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0015  phytanoyl-CoA dioxygenase  79.42 
 
 		 346 aa  518  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349617  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3963  phytanoyl-CoA dioxygenase  49.42 
 
 		 341 aa  289  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8686  phytanoyl-CoA dioxygenase  45.51 
 
 		 354 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1940  phytanoyl-CoA dioxygenase  45.78 
 
 		 355 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0322  phytanoyl-CoA dioxygenase  45.48 
 
 		 355 aa  258  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1839  Phytanoyl-CoA dioxygenase  44.15 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8688  Phytanoyl-CoA dioxygenase  46.96 
 
 		 326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6410  Phytanoyl-CoA dioxygenase  46.96 
 
 		 326 aa  242  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3918  phytanoyl-CoA dioxygenase  41.18 
 
 		 347 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5428  Phytanoyl-CoA dioxygenase  44.6 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0395279 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1510  hypothetical protein  33.94 
 
 		 317 aa  127  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0888  hypothetical protein  31.8 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.475505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4572  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.49 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1471  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1002 aa  42.4  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>