29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0631 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0631  Hedgehog/intein hint domain protein  100 
 
 		 462 aa  947    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2285  DNA polymerase I  26.84 
 
 		 1273 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153285  hitchhiker  0.0000116157 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  25.29 
 
 		 1412 aa  71.6  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1041  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  29.22 
 
 		 1225 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.588089  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0059  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  28.81 
 
 		 1416 aa  63.2  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.684931  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0803  DNA recombination protein RecA precursor  24.89 
 
 		 1177 aa  60.1  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106303  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1071  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  25.97 
 
 		 1197 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00208711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1381  SpoVR family protein  24.16 
 
 		 898 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4333  replicative DNA helicase  26.17 
 
 		 903 aa  57.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00796105  normal  0.47145 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0007  DNA gyrase, A subunit  25.41 
 
 		 1262 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641743 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0288  replicative DNA helicase  26.41 
 
 		 1272 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00145922  normal  0.0196343 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0781  RNA polymerase Rpb1 domain 5  25.77 
 
 		 907 aa  55.1  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0893602  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1025  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  26.73 
 
 		 1331 aa  55.1  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400039  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0587  XRE family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 1381 aa  54.7  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0434088  hitchhiker  0.00000000000000216733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0007  DNA gyrase subunit A  24.46 
 
 		 1257 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231135  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0015  DNA gyrase subunit A  24.46 
 
 		 1257 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336793  normal  0.0467397 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0653  DnaB domain-containing protein  23.89 
 
 		 1098 aa  52  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2587  replicative DNA helicase  25.62 
 
 		 879 aa  50.1  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00388825  normal  0.462592 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0015  replicative DNA helicase  23.71 
 
 		 945 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.756014  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1670  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  33.06 
 
 		 1240 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.346391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0425  protein splicing site  23.43 
 
 		 1985 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902882 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0821  DNA gyrase, A subunit  24.09 
 
 		 1261 aa  47  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308334  normal  0.183693 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  23.49 
 
 		 1531 aa  47  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3755  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  21.77 
 
 		 1184 aa  46.6  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.561834 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1608  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  37.88 
 
 		 1240 aa  46.6  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.863119 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3326  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  24.1 
 
 		 1779 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.62 
 
 		 1265 aa  44.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1586  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  24.58 
 
 		 1370 aa  43.9  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.945292  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10057  replicative DNA helicase  23.47 
 
 		 874 aa  43.5  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.66357e-17  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>