More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3134 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3134  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  100 
 
 
417 aa  838    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0468009  normal  0.227665 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1153  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  78.69 
 
 
418 aa  648    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2325  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  74.28 
 
 
418 aa  634    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0589  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  74.58 
 
 
418 aa  624  1e-178  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280654  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3114  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  72.9 
 
 
417 aa  606  9.999999999999999e-173  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.784914  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0802  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  75.3 
 
 
417 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.160818  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0811  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  50.24 
 
 
417 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1973  glutamate dehydrogenase (NAD/NADP)  48.92 
 
 
416 aa  410  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1201  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.94 
 
 
435 aa  411  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000645757  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4038  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  48.55 
 
 
426 aa  404  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0805  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  49.64 
 
 
419 aa  402  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3997  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  48.67 
 
 
415 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1790  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  49.28 
 
 
416 aa  401  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.152655  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0603  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  50.12 
 
 
412 aa  404  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1713  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  47.58 
 
 
420 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.494068  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0305  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  50.49 
 
 
427 aa  404  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.256409  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4511  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  48.1 
 
 
419 aa  402  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0166062  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1064  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  49.65 
 
 
427 aa  401  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1591  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  46.6 
 
 
416 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1722  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  48.91 
 
 
417 aa  397  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1485  glutamate dehydrogenase (NAD)  47.09 
 
 
416 aa  397  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.491869 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3380  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  49.27 
 
 
431 aa  392  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2689  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.13 
 
 
421 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.654737  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3761  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  48.4 
 
 
432 aa  390  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.060443  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1158  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  48.29 
 
 
424 aa  390  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3754  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.51 
 
 
428 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4115  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.38 
 
 
422 aa  385  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.764753  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2006  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.45 
 
 
417 aa  385  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0997  glutamate dehydrogenase  46.57 
 
 
413 aa  384  1e-105  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.148048  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2715  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.02 
 
 
428 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.832565 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1731  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  48.8 
 
 
416 aa  382  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3363  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.78 
 
 
437 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.39653  hitchhiker  0.00000359206 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2322  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.34 
 
 
425 aa  384  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.70061  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0635  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.27 
 
 
428 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400076  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0185  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.27 
 
 
428 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.484699  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0589  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.27 
 
 
428 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.374575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0563  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  46.02 
 
 
428 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.794737  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0668  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  46.27 
 
 
428 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2439  glutamate dehydrogenase  45.78 
 
 
434 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3435  glutamate dehydrogenase  45.78 
 
 
434 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.373293  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1224  glutamate dehydrogenase  45.54 
 
 
434 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2574  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.27 
 
 
430 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00446029 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0353  glutamate dehydrogenase  45.78 
 
 
434 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1212  glutamate dehydrogenase  45.78 
 
 
434 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3397  putative glutamate dehydrogenase  45.78 
 
 
434 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.972567  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3432  putative glutamate dehydrogenase  45.78 
 
 
434 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0536346  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2623  glutamate dehydrogenase  45.78 
 
 
434 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0793  hypothetical protein  45.65 
 
 
712 aa  377  1e-103  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0551425 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0596  glutamate dehydrogenase (NADP)  45.3 
 
 
440 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2942  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  48.4 
 
 
431 aa  377  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3671  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.01 
 
 
426 aa  375  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0706  glutamate dehydrogenase (NAD/NADP)  46.39 
 
 
416 aa  375  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.110428  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0546  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  44.15 
 
 
414 aa  372  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0179  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.04 
 
 
436 aa  374  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4385  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  46.28 
 
 
421 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113052  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3244  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  46.23 
 
 
416 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.71878  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1441  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  45.41 
 
 
439 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1312  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.01 
 
 
424 aa  374  1e-102  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000304599 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0724  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.8 
 
 
421 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0456  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal:Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerisation region  43.61 
 
 
435 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3239  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  44.69 
 
 
438 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0045949  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2811  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.48 
 
 
441 aa  371  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1583  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.42 
 
 
431 aa  369  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4808  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.28 
 
 
423 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5648  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.97 
 
 
424 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3745  putative glutamic dehyrogenase  45.28 
 
 
433 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.328579 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0356  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  43.37 
 
 
433 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0398  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  42.89 
 
 
435 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0386663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0183  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.04 
 
 
418 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.058595  normal  0.571657 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1333  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  44.9 
 
 
436 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0188  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  45.17 
 
 
433 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3799  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  44.36 
 
 
428 aa  364  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000116161  hitchhiker  0.0000000000363734 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0371  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  42.89 
 
 
433 aa  364  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1546  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  44.36 
 
 
428 aa  364  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000659966  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0977  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  43.41 
 
 
428 aa  363  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0958  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  43.41 
 
 
428 aa  363  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.323715  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2621  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.49 
 
 
419 aa  363  2e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0300  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.08 
 
 
421 aa  363  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2473  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  44.04 
 
 
424 aa  362  5.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1413  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  43.87 
 
 
428 aa  362  6e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010312  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0167  glutamate dehydrogenase (NAD/NADP)  45.01 
 
 
442 aa  362  6e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.426909  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1617  glutamate dehydrogenase  44.12 
 
 
428 aa  361  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000388705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1401  glutamate dehydrogenase  44.12 
 
 
428 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000229011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1373  glutamate dehydrogenase  44.12 
 
 
428 aa  361  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.02458e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1372  glutamate dehydrogenase  44.12 
 
 
428 aa  361  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383357  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1511  glutamate dehydrogenase  44.12 
 
 
428 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000126208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1585  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  44.12 
 
 
428 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.25927e-30 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0153  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  44.44 
 
 
434 aa  362  1e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1652  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  44.12 
 
 
428 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000895383  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0135  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  44.44 
 
 
434 aa  361  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0494  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.02 
 
 
440 aa  360  3e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1626  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.17 
 
 
427 aa  360  3e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000993882 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1505  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  43.37 
 
 
445 aa  360  4e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3265  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  46.17 
 
 
419 aa  359  5e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2183  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  44.06 
 
 
428 aa  358  7e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0550641  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0480  glutamate dehydrogenase (NAD(P)+) oxidoreductase protein  42.17 
 
 
433 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0227  glutamate dehydrogenase, putative  44.89 
 
 
421 aa  358  9.999999999999999e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08360  glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase  44.9 
 
 
459 aa  358  9.999999999999999e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0598327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1204  glutamate dehydrogenase (NADP)  43.71 
 
 
429 aa  358  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0211  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  43.96 
 
 
434 aa  358  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>