More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0188 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0480  glutamate dehydrogenase (NAD(P)+) oxidoreductase protein  77.42 
 
 
433 aa  698    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2439  glutamate dehydrogenase  78.24 
 
 
434 aa  710    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0371  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  77.19 
 
 
433 aa  699    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0456  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal:Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerisation region  78.47 
 
 
435 aa  701    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3435  glutamate dehydrogenase  78.24 
 
 
434 aa  710    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.373293  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2574  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  78.01 
 
 
430 aa  707    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00446029 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3754  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  79.57 
 
 
428 aa  708    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1224  glutamate dehydrogenase  78.47 
 
 
434 aa  712    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0589  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  79.57 
 
 
428 aa  709    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.374575 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3239  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  79.67 
 
 
438 aa  714    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0045949  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0596  glutamate dehydrogenase (NADP)  76.83 
 
 
440 aa  697    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0211  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  90.38 
 
 
434 aa  794    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2715  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  79.2 
 
 
428 aa  711    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.832565 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0398  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  78.72 
 
 
435 aa  694    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0386663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3363  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  75.87 
 
 
437 aa  697    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.39653  hitchhiker  0.00000359206 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0494  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  71.16 
 
 
440 aa  639    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0356  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  78.34 
 
 
433 aa  706    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0185  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  79.72 
 
 
428 aa  711    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.484699  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0635  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  79.72 
 
 
428 aa  711    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400076  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0563  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  79.1 
 
 
428 aa  707    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.794737  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0668  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  79.72 
 
 
428 aa  711    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0188  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  100 
 
 
433 aa  882    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1441  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  78.59 
 
 
439 aa  724    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0135  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  86.64 
 
 
434 aa  776    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0353  glutamate dehydrogenase  78.24 
 
 
434 aa  710    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1702  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  85.91 
 
 
433 aa  761    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3745  putative glutamic dehyrogenase  73.27 
 
 
433 aa  640    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.328579 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1212  glutamate dehydrogenase  78.24 
 
 
434 aa  710    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0153  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  86.87 
 
 
434 aa  778    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3397  putative glutamate dehydrogenase  78.24 
 
 
434 aa  710    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.972567  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3432  putative glutamate dehydrogenase  78.24 
 
 
434 aa  710    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0536346  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2623  glutamate dehydrogenase  78.24 
 
 
434 aa  710    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4808  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  73.27 
 
 
423 aa  631  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1626  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  71.87 
 
 
427 aa  625  1e-178  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000993882 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1333  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  66.35 
 
 
436 aa  597  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2721  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal:Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerization region  64.45 
 
 
427 aa  578  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800328 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0389  glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  66.35 
 
 
425 aa  577  1.0000000000000001e-163  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.162491  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1505  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  65.63 
 
 
445 aa  577  1.0000000000000001e-163  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2473  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  63.48 
 
 
424 aa  573  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1524  glutamate dehydrogenase  65.39 
 
 
424 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1932  glutamate dehydrogenase  65.39 
 
 
424 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1339  glutamate dehydrogenase  65.39 
 
 
424 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.919787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1992  glutamate dehydrogenase  65.39 
 
 
424 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1936  glutamate dehydrogenase  65.39 
 
 
424 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.957815  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1230  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  64.2 
 
 
424 aa  560  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4511  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  53.49 
 
 
419 aa  465  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0166062  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0805  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  53.04 
 
 
419 aa  449  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1790  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  53.69 
 
 
416 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.152655  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1064  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  52 
 
 
427 aa  445  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1722  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  54.03 
 
 
417 aa  445  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0305  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  51.05 
 
 
427 aa  442  1e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.256409  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1713  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  49.52 
 
 
420 aa  435  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.494068  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2006  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  52.47 
 
 
417 aa  432  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1731  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  53.69 
 
 
416 aa  430  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4115  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  50 
 
 
422 aa  425  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.764753  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2689  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  52.96 
 
 
421 aa  421  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.654737  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0724  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  49.64 
 
 
421 aa  420  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4385  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  49.17 
 
 
421 aa  414  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113052  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0603  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  52.08 
 
 
412 aa  411  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0811  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  50.12 
 
 
417 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1591  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  49.03 
 
 
416 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00880  glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase  50 
 
 
426 aa  404  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2327  glutamate dehydrogenase (NADP)  52.47 
 
 
428 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1546  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  50.26 
 
 
428 aa  396  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000659966  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08360  glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase  49.27 
 
 
459 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0598327 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3799  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  50.26 
 
 
428 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000116161  hitchhiker  0.0000000000363734 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1583  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.39 
 
 
431 aa  398  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1617  glutamate dehydrogenase  50 
 
 
428 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000388705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1401  glutamate dehydrogenase  50 
 
 
428 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000229011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1373  glutamate dehydrogenase  50 
 
 
428 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.02458e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1372  glutamate dehydrogenase  50 
 
 
428 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383357  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1585  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  50 
 
 
428 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.25927e-30 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2183  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  49.37 
 
 
428 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0550641  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1511  glutamate dehydrogenase  50 
 
 
428 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000126208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1413  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  49.48 
 
 
428 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010312  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0445  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  49.12 
 
 
423 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2404  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  48.58 
 
 
427 aa  395  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.912024  hitchhiker  0.00345076 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1389  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  49.88 
 
 
428 aa  393  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0790615  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1485  glutamate dehydrogenase (NAD)  48.88 
 
 
416 aa  394  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.491869 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1652  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  50 
 
 
428 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000895383  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0997  glutamate dehydrogenase  49.09 
 
 
413 aa  390  1e-107  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.148048  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1961  response regulator receiver protein  51.29 
 
 
549 aa  388  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2621  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  50.39 
 
 
419 aa  386  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0958  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  48.18 
 
 
428 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.323715  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0183  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.07 
 
 
418 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.058595  normal  0.571657 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0977  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  48.18 
 
 
428 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1214  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  50.52 
 
 
427 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1201  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.87 
 
 
435 aa  378  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000645757  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1204  glutamate dehydrogenase (NADP)  47.03 
 
 
429 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1973  glutamate dehydrogenase (NAD/NADP)  47.55 
 
 
416 aa  377  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3494  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.69 
 
 
416 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.882332  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3619  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.27 
 
 
424 aa  375  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0770493  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5648  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.38 
 
 
424 aa  376  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4038  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.15 
 
 
426 aa  371  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0546  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  47.14 
 
 
414 aa  371  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3761  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.16 
 
 
432 aa  369  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.060443  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4390  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.82 
 
 
418 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.252025  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3997  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.53 
 
 
415 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2839  glutamate dehydrogenase (NAD(P)+) oxidoreductase protein  46.55 
 
 
419 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0300  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.42 
 
 
421 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>