More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3114 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3114  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  100 
 
 
417 aa  833    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.784914  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0802  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  74.7 
 
 
417 aa  600  1e-170  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.160818  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0589  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  73.61 
 
 
418 aa  597  1e-169  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280654  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2325  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  71.15 
 
 
418 aa  591  1e-168  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1153  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  73.12 
 
 
418 aa  593  1e-168  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3134  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  72.9 
 
 
417 aa  587  1e-166  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0468009  normal  0.227665 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1201  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  48.84 
 
 
435 aa  415  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000645757  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4038  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  50.12 
 
 
426 aa  411  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3380  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  52.07 
 
 
431 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3761  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  51.11 
 
 
432 aa  404  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.060443  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1158  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  50.73 
 
 
424 aa  404  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0805  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  48.2 
 
 
419 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1790  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  49.04 
 
 
416 aa  395  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.152655  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2322  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  48.29 
 
 
425 aa  394  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.70061  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3671  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  48.66 
 
 
426 aa  392  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2942  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  50.86 
 
 
431 aa  389  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4511  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.89 
 
 
419 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0166062  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2811  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  50.12 
 
 
441 aa  385  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1713  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  46.39 
 
 
420 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.494068  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1485  glutamate dehydrogenase (NAD)  47.07 
 
 
416 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.491869 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0305  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  46.84 
 
 
427 aa  384  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.256409  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0811  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.93 
 
 
417 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2689  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.58 
 
 
421 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.654737  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1064  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.1 
 
 
427 aa  379  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1731  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  48.33 
 
 
416 aa  376  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1591  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  44.44 
 
 
416 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5648  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  48.39 
 
 
424 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0793  hypothetical protein  44.85 
 
 
712 aa  372  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0551425 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1722  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  46.76 
 
 
417 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0603  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  47.7 
 
 
412 aa  372  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0724  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  47.24 
 
 
421 aa  365  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2623  glutamate dehydrogenase  45.54 
 
 
434 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2439  glutamate dehydrogenase  45.54 
 
 
434 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2715  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.3 
 
 
428 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.832565 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3435  glutamate dehydrogenase  45.54 
 
 
434 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.373293  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3754  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.54 
 
 
428 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1224  glutamate dehydrogenase  45.3 
 
 
434 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1973  glutamate dehydrogenase (NAD/NADP)  44.1 
 
 
416 aa  365  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0185  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.54 
 
 
428 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.484699  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0635  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.54 
 
 
428 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400076  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1626  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.8 
 
 
427 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000993882 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0563  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  45.3 
 
 
428 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.794737  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0668  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  45.54 
 
 
428 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1074  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  44.82 
 
 
428 aa  366  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0589  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.54 
 
 
428 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.374575 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0353  glutamate dehydrogenase  45.54 
 
 
434 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3745  putative glutamic dehyrogenase  45.19 
 
 
433 aa  368  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.328579 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1212  glutamate dehydrogenase  45.54 
 
 
434 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3397  putative glutamate dehydrogenase  45.54 
 
 
434 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.972567  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3432  putative glutamate dehydrogenase  45.54 
 
 
434 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0536346  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4385  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  47.12 
 
 
421 aa  364  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113052  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0456  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal:Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, dimerisation region  44.93 
 
 
435 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0398  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  44.34 
 
 
435 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0386663 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3997  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  44.23 
 
 
415 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2006  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.8 
 
 
417 aa  360  3e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1312  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  44.16 
 
 
424 aa  360  3e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000304599 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0596  glutamate dehydrogenase (NADP)  45.54 
 
 
440 aa  359  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0356  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.3 
 
 
433 aa  359  5e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3363  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.06 
 
 
437 aa  358  8e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.39653  hitchhiker  0.00000359206 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2473  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  44.47 
 
 
424 aa  358  9e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0371  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  44.82 
 
 
433 aa  358  9e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0188  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  44.58 
 
 
433 aa  358  9e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0480  glutamate dehydrogenase (NAD(P)+) oxidoreductase protein  44.82 
 
 
433 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4115  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  42.89 
 
 
422 aa  355  8.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.764753  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2574  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  44.82 
 
 
430 aa  354  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00446029 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0153  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  44.23 
 
 
434 aa  354  2e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0494  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  46.39 
 
 
440 aa  353  2e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0300  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  43.88 
 
 
421 aa  354  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1441  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  43.61 
 
 
439 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4908  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  43.97 
 
 
428 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0135  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  44.23 
 
 
434 aa  353  4e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1583  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.01 
 
 
431 aa  353  4e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0227  glutamate dehydrogenase, putative  44.66 
 
 
421 aa  353  5e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0997  glutamate dehydrogenase  43.18 
 
 
413 aa  352  5.9999999999999994e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.148048  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0218  putative glutamate dehydrogenase  44.66 
 
 
421 aa  352  5.9999999999999994e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0546  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  43.55 
 
 
414 aa  351  1e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1546  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  43.56 
 
 
428 aa  350  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000659966  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3799  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  43.56 
 
 
428 aa  350  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000116161  hitchhiker  0.0000000000363734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4808  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  44.47 
 
 
423 aa  350  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1702  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  44.58 
 
 
433 aa  350  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1505  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.17 
 
 
445 aa  349  4e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0211  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  43.86 
 
 
434 aa  350  4e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3239  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  43.61 
 
 
438 aa  349  6e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0045949  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0183  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.07 
 
 
418 aa  348  8e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.058595  normal  0.571657 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1617  glutamate dehydrogenase  43.32 
 
 
428 aa  348  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000388705  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1652  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  43.32 
 
 
428 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000895383  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3400  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.81 
 
 
424 aa  348  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1401  glutamate dehydrogenase  43.32 
 
 
428 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000229011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1373  glutamate dehydrogenase  43.32 
 
 
428 aa  347  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.02458e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1372  glutamate dehydrogenase  43.32 
 
 
428 aa  347  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383357  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1204  glutamate dehydrogenase (NADP)  43.65 
 
 
429 aa  347  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1511  glutamate dehydrogenase  43.32 
 
 
428 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000126208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1585  glutamate dehydrogenase, NAD-specific  43.32 
 
 
428 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.25927e-30 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3244  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase, C terminal  46.08 
 
 
416 aa  345  8e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.71878  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08360  glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase  44.17 
 
 
459 aa  345  8.999999999999999e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0598327 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5459  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  45.32 
 
 
420 aa  344  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2621  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  44.07 
 
 
419 aa  345  1e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1413  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  42.82 
 
 
428 aa  344  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010312  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2183  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  43 
 
 
428 aa  342  5e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0550641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2327  glutamate dehydrogenase (NADP)  45.5 
 
 
428 aa  342  5e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>