251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0548 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0548  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
357 aa  696    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0176894  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3205  glycosyl transferase family 2  52 
 
 
306 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.159852 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1306  glycosyl transferase family 2  47.58 
 
 
299 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2830  glycosyl transferase family 2  46.88 
 
 
301 aa  265  7e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2904  glycosyl transferase family 2  46.13 
 
 
300 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 
233 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.36 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  35.71 
 
 
236 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  35.96 
 
 
272 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
924 aa  62.8  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 
337 aa  62.8  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  34.85 
 
 
232 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 
1435 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  27.59 
 
 
333 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  34.85 
 
 
240 aa  59.7  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  25.22 
 
 
311 aa  59.7  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3678  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
289 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5657  glycosyl transferase family 2  22.32 
 
 
303 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.49465 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  24.02 
 
 
1077 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  24.78 
 
 
311 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  37.5 
 
 
792 aa  56.2  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  24.44 
 
 
304 aa  56.2  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 
297 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
301 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 
297 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 
785 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0011  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 
291 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000912491 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
238 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 
260 aa  55.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0968  hypothetical protein  30 
 
 
235 aa  54.3  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.683686  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3205  glycosyltransferase  29.2 
 
 
253 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3459  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.7 
 
 
253 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0198533  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  39.08 
 
 
324 aa  53.1  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3138  glycosyltransferase  27.83 
 
 
253 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  36.96 
 
 
344 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  34.35 
 
 
232 aa  53.1  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0380  glycosyl transferase family 2  38 
 
 
298 aa  53.1  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0010  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
275 aa  52.8  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.591764  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 
322 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  35.09 
 
 
461 aa  52  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  35.79 
 
 
700 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  35.16 
 
 
358 aa  52  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  31.53 
 
 
2401 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3232  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.32 
 
 
193 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0263281  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3520  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.43 
 
 
323 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  31.68 
 
 
274 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1687  glycosyl transferase family protein  36.44 
 
 
306 aa  51.6  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165254  normal  0.0664062 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
235 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 
308 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  24.39 
 
 
331 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1586  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
444 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807446  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2588  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 
306 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  23.4 
 
 
345 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08980  glycosyl transferase  27.74 
 
 
329 aa  50.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001770  probable glycosyl transferase  29.35 
 
 
292 aa  50.8  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2545  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 
245 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  24.78 
 
 
315 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  38.95 
 
 
672 aa  50.8  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 
327 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0860  b-glycosyltransferase  30.09 
 
 
314 aa  50.8  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0642732 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1913  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
286 aa  50.4  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.76 
 
 
327 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1581  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 
466 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 
280 aa  50.4  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  37.25 
 
 
310 aa  50.1  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 
300 aa  50.1  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  23.35 
 
 
321 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
1162 aa  50.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  21.23 
 
 
348 aa  50.1  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3933  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.45 
 
 
329 aa  49.7  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3434  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.96 
 
 
253 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02310  glycosyl transferase  37.37 
 
 
354 aa  49.7  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 
457 aa  49.3  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
470 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
312 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  34.07 
 
 
344 aa  49.3  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  34.78 
 
 
344 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  25.76 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 
344 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  37.04 
 
 
266 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  34.78 
 
 
344 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0263  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
341 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  26.53 
 
 
338 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3690  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.45 
 
 
329 aa  49.3  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.76 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  29 
 
 
298 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0058  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.246717 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.76 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  36.08 
 
 
334 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  34.78 
 
 
344 aa  48.9  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  34.78 
 
 
344 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  35.79 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  34.78 
 
 
344 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  25.76 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 
470 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3446  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.09 
 
 
253 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
333 aa  49.3  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
312 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3442  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.22 
 
 
253 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.184184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  24.64 
 
 
525 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>