32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0749 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0749  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  238  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  64.84 
 
 		 139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  46.43 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  45.24 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  35 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  35.87 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  40 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1627  PilT protein domain protein  35 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733144  normal  0.420461 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1771  hypothetical protein  34.52 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  48.21 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8106  PilT protein domain protein  34.94 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  35 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1484  hypothetical protein  33.98 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174904  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  41.94 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  35.16 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3682  PilT domain-containing protein  46.43 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.362926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  33.75 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  37.5 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  43.55 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  32.5 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  29.79 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  29.79 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  34.09 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  35 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  43.14 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  43.14 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0058  PilT protein domain protein  38.37 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  45.1 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0138  PilT domain-containing protein  38.24 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0154  PilT domain-containing protein  38.24 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  37.88 
 
 		 130 aa  40  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>