25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4126 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4126  Protein of unknown function DUF2071  100 
 
 
242 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.825341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0879  hypothetical protein  63.68 
 
 
257 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0511068  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5314  hypothetical protein  61.28 
 
 
243 aa  255  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0342  Protein of unknown function DUF2071  60.17 
 
 
250 aa  251  6e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.665792 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11956  hypothetical protein  49.79 
 
 
257 aa  191  9e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.731053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1775  hypothetical protein  51.53 
 
 
246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.83845 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0444  hypothetical protein  50 
 
 
245 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.454642  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1847  Protein of unknown function DUF2071  50 
 
 
256 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0348676  normal  0.0718849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0899  hypothetical protein  45.98 
 
 
240 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1914  hypothetical protein  41.49 
 
 
262 aa  151  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391996  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4491  hypothetical protein  35.38 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2704  hypothetical protein  38.7 
 
 
228 aa  113  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.215523  normal  0.0278118 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0115  hypothetical protein  37.21 
 
 
247 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1158  hypothetical protein  26.25 
 
 
238 aa  82.4  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1200  hypothetical protein  34.91 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000395565  hitchhiker  0.00000439593 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3600  Protein of unknown function DUF2071  32.75 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1776  Protein of unknown function DUF2071  29.51 
 
 
245 aa  79  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348192  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2703  hypothetical protein  34.72 
 
 
243 aa  78.6  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306076  normal  0.0313729 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2105  Protein of unknown function DUF2071  30.13 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0378  hypothetical protein  24.67 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0504645  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1656  hypothetical protein  36.84 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.918298  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3662  Protein of unknown function DUF2071  28.12 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0637  hypothetical protein  26.52 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000268172  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0866  Protein of unknown function DUF2071  28.86 
 
 
263 aa  62  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0440  hypothetical protein  22.16 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.247596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>