22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0378 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0378  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  495  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0504645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1158  hypothetical protein  52.79 
 
 		 238 aa  275  5e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1776  Protein of unknown function DUF2071  48.56 
 
 		 245 aa  243  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348192  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0440  hypothetical protein  51.71 
 
 		 245 aa  236  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.247596  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0637  hypothetical protein  33.77 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000268172  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4126  Protein of unknown function DUF2071  24.67 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.825341  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1847  Protein of unknown function DUF2071  24.8 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0348676  normal  0.0718849 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5314  hypothetical protein  27.64 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4491  hypothetical protein  38.37 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2105  Protein of unknown function DUF2071  28.12 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0115  hypothetical protein  24.55 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0444  hypothetical protein  24.22 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.454642  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0879  hypothetical protein  21.95 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0511068  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0866  Protein of unknown function DUF2071  36.9 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2704  hypothetical protein  22.86 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.215523  normal  0.0278118 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0342  Protein of unknown function DUF2071  23.68 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.665792 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1656  hypothetical protein  35.71 
 
 		 264 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.918298  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3600  Protein of unknown function DUF2071  25.77 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1914  hypothetical protein  21.72 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1200  hypothetical protein  34.21 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000395565  hitchhiker  0.00000439593 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3662  Protein of unknown function DUF2071  29.17 
 
 		 290 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0899  hypothetical protein  26.6 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>