24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1914 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1914  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  522  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391996  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0342  Protein of unknown function DUF2071  44.55 
 
 
250 aa  158  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.665792 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4126  Protein of unknown function DUF2071  41.49 
 
 
242 aa  151  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.825341  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5314  hypothetical protein  41.56 
 
 
243 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11956  hypothetical protein  39.59 
 
 
257 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.731053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1775  hypothetical protein  41.53 
 
 
246 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.83845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0879  hypothetical protein  41.53 
 
 
257 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0511068  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4491  hypothetical protein  37.21 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0444  hypothetical protein  42.06 
 
 
245 aa  132  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.454642  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3600  Protein of unknown function DUF2071  34.36 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0115  hypothetical protein  33.91 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1847  Protein of unknown function DUF2071  37.33 
 
 
256 aa  111  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0348676  normal  0.0718849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0899  hypothetical protein  36.21 
 
 
240 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2704  hypothetical protein  34.48 
 
 
228 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.215523  normal  0.0278118 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1200  hypothetical protein  32.51 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000395565  hitchhiker  0.00000439593 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1656  hypothetical protein  36.4 
 
 
264 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.918298  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2105  Protein of unknown function DUF2071  29.49 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2703  hypothetical protein  32.44 
 
 
243 aa  75.1  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306076  normal  0.0313729 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3662  Protein of unknown function DUF2071  30.4 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0866  Protein of unknown function DUF2071  29.75 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1158  hypothetical protein  22 
 
 
238 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0378  hypothetical protein  21.72 
 
 
239 aa  52.4  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0504645  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0440  hypothetical protein  25.89 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.247596  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1776  Protein of unknown function DUF2071  29.01 
 
 
245 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348192  normal  0.652565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>