25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0879 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0879  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  504  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0511068  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4126  Protein of unknown function DUF2071  64.14 
 
 
242 aa  277  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.825341  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5314  hypothetical protein  57.02 
 
 
243 aa  245  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0342  Protein of unknown function DUF2071  55.1 
 
 
250 aa  230  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.665792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1775  hypothetical protein  50.2 
 
 
246 aa  188  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.83845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11956  hypothetical protein  46.61 
 
 
257 aa  184  8e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.731053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0444  hypothetical protein  51.42 
 
 
245 aa  185  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.454642  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1847  Protein of unknown function DUF2071  48.13 
 
 
256 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0348676  normal  0.0718849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0899  hypothetical protein  45.08 
 
 
240 aa  156  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1914  hypothetical protein  41.53 
 
 
262 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391996  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4491  hypothetical protein  34.76 
 
 
257 aa  99.4  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2704  hypothetical protein  36.56 
 
 
228 aa  97.4  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.215523  normal  0.0278118 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1200  hypothetical protein  31.78 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000395565  hitchhiker  0.00000439593 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0115  hypothetical protein  29.65 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1656  hypothetical protein  36.87 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.918298  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2703  hypothetical protein  32.74 
 
 
243 aa  68.6  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306076  normal  0.0313729 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2105  Protein of unknown function DUF2071  29.69 
 
 
260 aa  63.9  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0866  Protein of unknown function DUF2071  26.34 
 
 
263 aa  60.8  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1158  hypothetical protein  22.56 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3600  Protein of unknown function DUF2071  29.13 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0378  hypothetical protein  21.95 
 
 
239 aa  55.5  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0504645  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3662  Protein of unknown function DUF2071  24.55 
 
 
290 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1776  Protein of unknown function DUF2071  27.52 
 
 
245 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348192  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0637  hypothetical protein  22.88 
 
 
236 aa  49.3  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000268172  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0440  hypothetical protein  20.42 
 
 
245 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.247596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>