20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11956 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11956  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.731053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1775  hypothetical protein  68.62 
 
 
246 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.83845 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0342  Protein of unknown function DUF2071  47.13 
 
 
250 aa  202  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.665792 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5314  hypothetical protein  50.84 
 
 
243 aa  201  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4126  Protein of unknown function DUF2071  49.79 
 
 
242 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.825341  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0444  hypothetical protein  46.19 
 
 
245 aa  186  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.454642  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0899  hypothetical protein  48.09 
 
 
240 aa  182  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0879  hypothetical protein  47.06 
 
 
257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0511068  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1847  Protein of unknown function DUF2071  44.86 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0348676  normal  0.0718849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1914  hypothetical protein  39.59 
 
 
262 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391996  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2704  hypothetical protein  31.11 
 
 
228 aa  85.1  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.215523  normal  0.0278118 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4491  hypothetical protein  25.81 
 
 
257 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0866  Protein of unknown function DUF2071  28.12 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0115  hypothetical protein  28.37 
 
 
247 aa  59.7  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1656  hypothetical protein  30.2 
 
 
264 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.918298  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1200  hypothetical protein  26.61 
 
 
237 aa  56.2  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000395565  hitchhiker  0.00000439593 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2703  hypothetical protein  25.97 
 
 
243 aa  53.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306076  normal  0.0313729 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2105  Protein of unknown function DUF2071  24.78 
 
 
260 aa  49.7  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3662  Protein of unknown function DUF2071  22.62 
 
 
290 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3600  Protein of unknown function DUF2071  23.87 
 
 
231 aa  46.2  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>