More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2716 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2716  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
185 aa  378  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1017  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  69.73 
 
 
185 aa  280  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00200777  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3593  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  63.04 
 
 
185 aa  248  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0947  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  64.13 
 
 
185 aa  246  9e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209419  normal  0.496257 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0670  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  62.5 
 
 
185 aa  246  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4727  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  63.59 
 
 
185 aa  244  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.18113  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0970  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  62.5 
 
 
185 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.371954  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1131  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  61.96 
 
 
185 aa  238  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61460  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  61.41 
 
 
185 aa  234  7e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.345995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5294  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  61.41 
 
 
185 aa  234  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0747  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  59.78 
 
 
185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.538514  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0775  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  59.78 
 
 
185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0788  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  59.78 
 
 
185 aa  230  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.954834 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41350  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  60.33 
 
 
185 aa  229  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4442  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  59.24 
 
 
185 aa  228  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3004  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  58.24 
 
 
183 aa  226  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2065  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  55.19 
 
 
193 aa  207  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0541  phosphoribosyltransferase  55.31 
 
 
183 aa  203  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0074158  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0554  phosphoribosyltransferase  54.19 
 
 
183 aa  202  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000207672 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1752  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.43 
 
 
185 aa  201  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1031  phosphoribosyltransferase  53.63 
 
 
183 aa  200  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.596524  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0456  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  53.26 
 
 
181 aa  197  9e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1720  phosphoribosyltransferase  47.83 
 
 
183 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0563366  normal  0.0124135 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1507  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52 
 
 
189 aa  185  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1476  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52 
 
 
189 aa  184  5e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0858  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.57 
 
 
186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.232232  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1176  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48 
 
 
201 aa  180  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2948  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 
180 aa  174  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3095  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.56 
 
 
180 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2812  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
182 aa  168  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.500056  normal  0.134526 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3057  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
182 aa  168  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.549444  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1985  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  49.16 
 
 
187 aa  167  7e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.081374  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2647  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.6 
 
 
182 aa  167  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1260  phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
197 aa  165  4e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2644  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
183 aa  162  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1245  phosphoribosyltransferase  44.2 
 
 
183 aa  160  7e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1280  phosphoribosyltransferase  48.47 
 
 
185 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000936935 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3674  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.19 
 
 
183 aa  160  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398629  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2794  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.22 
 
 
183 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0517  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 
183 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0361295  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0107  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.11 
 
 
183 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0492  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 
183 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0589  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.11 
 
 
183 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0559  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.11 
 
 
183 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253345  hitchhiker  0.000600217 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0777  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.9 
 
 
185 aa  159  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.761508  normal  0.573522 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1148  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.19 
 
 
199 aa  158  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.918152  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1328  phosphoribosyltransferase  49.16 
 
 
198 aa  158  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.341069  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1397  phosphoribosyltransferase  46.02 
 
 
195 aa  157  9e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3267  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
183 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2515  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
183 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.623647  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3516  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
183 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65998  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3518  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
183 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1296  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
183 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3480  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
183 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47681  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0437  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
183 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1736  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
182 aa  156  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3441  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
183 aa  153  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00042277  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0515  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
183 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0649  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  44.94 
 
 
181 aa  147  7e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.480108  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0364  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase, putative  41.86 
 
 
194 aa  141  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1792  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.68 
 
 
191 aa  141  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00418451  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0534  phosphoribosyltransferase  41.86 
 
 
194 aa  141  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0649292  unclonable  0.0000000000263793 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1293  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  37.91 
 
 
187 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1125  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  37.91 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0150498  normal  0.2739 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1210  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  38.46 
 
 
188 aa  134  8e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01729  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  39.11 
 
 
184 aa  124  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1524  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  36.87 
 
 
184 aa  121  7e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1467  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  36.87 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.17916  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2967  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  38.55 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  hitchhiker  0.0000476225 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0472  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  32.16 
 
 
188 aa  101  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0108255  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1925  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
178 aa  100  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0267  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  30.23 
 
 
180 aa  94.7  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1124  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  30.3 
 
 
187 aa  93.6  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2787  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  29.67 
 
 
183 aa  92  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2473  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  29.12 
 
 
183 aa  90.9  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1606  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  32.75 
 
 
180 aa  89  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.126532  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  33.53 
 
 
180 aa  88.2  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0059  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 
180 aa  87.8  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5245  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 
180 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0688  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  27.38 
 
 
177 aa  87  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0107  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
182 aa  87.4  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.576089 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0071  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 
180 aa  87  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0062  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 
180 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0072  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 
180 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 
180 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 
180 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 
180 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0075  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 
180 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0888602  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3803  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  26.79 
 
 
176 aa  84.7  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2046  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  29.94 
 
 
184 aa  84.7  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1928  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.99 
 
 
174 aa  84.7  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0199  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0299222  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0140  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  27.71 
 
 
174 aa  84  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000569861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0641  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.9 
 
 
177 aa  84  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.801586  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3145  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  26.59 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0822  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  26.59 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0793  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  26.59 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1746  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  27.71 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.477142  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3192  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>