184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4174 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4174  Siderophore-interacting protein  100 
 
 
290 aa  583  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3380  siderophore-interacting protein  46.23 
 
 
272 aa  236  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384925  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3144  siderophore-interacting protein  47.95 
 
 
270 aa  229  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26750  siderophore-interacting protein  39.79 
 
 
296 aa  185  8e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.27893  normal  0.341302 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3695  Siderophore-interacting protein  36.77 
 
 
298 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37330  siderophore-interacting protein  31.27 
 
 
291 aa  145  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1918  siderophore-interacting protein  32.88 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149107  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  30.96 
 
 
284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  33.48 
 
 
270 aa  112  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3586  Siderophore-interacting protein  29.03 
 
 
279 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0021  siderophore-interacting protein  29.32 
 
 
275 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1528  siderophore-interacting protein  29.32 
 
 
275 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1592  Siderophore-interacting protein  37.22 
 
 
259 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1173  siderophore-interacting protein  29.32 
 
 
275 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1453  siderophore-interacting protein  29.32 
 
 
275 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0029  siderophore-interacting protein  29.32 
 
 
275 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000742042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0027  siderophore-interacting protein  29.32 
 
 
275 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0026  siderophore-interacting protein  29.32 
 
 
275 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  33.06 
 
 
247 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3804  siderophore-interacting protein  33.33 
 
 
277 aa  102  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48919  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1856  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.38 
 
 
283 aa  99.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0769877  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2693  Siderophore-interacting protein  34.12 
 
 
272 aa  99.8  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0023  siderophore-interacting protein  27.82 
 
 
275 aa  99  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1323  Siderophore-interacting protein  34.05 
 
 
297 aa  99  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09730  siderophore-interacting protein  32.81 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.222844  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1860  iron-chelator utilization protein  32.93 
 
 
273 aa  97.4  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3427  siderophore-interacting protein  33.6 
 
 
277 aa  96.7  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0328876  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0363  Siderophore-interacting protein  27.46 
 
 
265 aa  96.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3927  siderophore-interacting protein  29.51 
 
 
255 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4573  siderophore-interacting protein  30.12 
 
 
261 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4193  iron utilization protein, putative  29.46 
 
 
255 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  30.04 
 
 
281 aa  95.5  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2699  siderophore-interacting protein  32 
 
 
304 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.295882  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3477  Siderophore-interacting protein  30.92 
 
 
289 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5976  iron transport/utilisation related protein  28.68 
 
 
280 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2442  Siderophore-interacting protein  31.87 
 
 
267 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.402244  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4106  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.17 
 
 
280 aa  91.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375544  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4373  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  29.24 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0726253  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0912  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.54 
 
 
274 aa  89.7  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1601  Siderophore-interacting protein  30.52 
 
 
265 aa  89.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.52 
 
 
281 aa  89  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2724  Siderophore-interacting protein  36.16 
 
 
311 aa  89  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5107  iron utilization protein  35.26 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0918  Siderophore-interacting protein  31.68 
 
 
273 aa  88.6  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2998  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.69 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0124793  normal  0.0292007 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13510  siderophore-interacting protein  29.51 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3043  siderophore-interacting protein  32.57 
 
 
623 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3163  siderophore-interacting protein  27.53 
 
 
273 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1091  putative iron transport/utilisation related protein  28.74 
 
 
275 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0143564 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2919  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  28.87 
 
 
272 aa  87  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0118  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  28.12 
 
 
370 aa  87  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5308  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  27.53 
 
 
270 aa  86.7  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  28.35 
 
 
283 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0336  siderophore-interacting protein  30.65 
 
 
361 aa  85.9  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4356  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  28.69 
 
 
253 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0535  Siderophore-interacting protein  31.46 
 
 
617 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.911825  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1901  siderophore-interacting protein  28.11 
 
 
366 aa  82.4  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2810  FAD-binding 9, siderophore-interacting  29.74 
 
 
348 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.445177  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0127  siderophore-interacting protein  33.33 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.636914  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1086  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  27.46 
 
 
252 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1914  siderophore-interacting protein  29.47 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.282091  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1159  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.6 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139634  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1773  siderophore-interacting protein  27.64 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5136  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  27.82 
 
 
278 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.509715  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3532  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  27.94 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400944  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3787  Siderophore-interacting protein  32.2 
 
 
290 aa  79.7  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271751 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3687  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.99 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443256  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2184  siderophore-interacting protein  29.21 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249595  normal  0.170908 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17630  siderophore-interacting protein  30.08 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.868687  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4986  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  26.21 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  26.86 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1126  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.31 
 
 
271 aa  77  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.382701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38220  hypothetical protein  25.93 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06920  hypothetical protein  25.21 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4275  siderophore-interacting protein  33.33 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.716792  normal  0.162196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4296  Siderophore-interacting protein  27.38 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000530029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3129  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  25.51 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1056  iron-chelator utilization protein, putative  26.45 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5142  FAD-binding 9, siderophore-interacting  26.32 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5717  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  26.32 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20830  siderophore-interacting protein  31.84 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.93855  normal  0.0153538 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2448  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  26.56 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4522  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  26.32 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45393  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03709  hypothetical protein  25.55 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3953  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  25.76 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.568339  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4066  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  25.76 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515055 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2366  Siderophore-interacting protein  29.95 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.277442  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1452  Siderophore-interacting protein  28.05 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.100932  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3524  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  24.14 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.326071  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5386  Siderophore-interacting protein  31.94 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0562315 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0833  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  27.67 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0888  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  28.03 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1968  siderophore-interacting protein  31.77 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2566  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  28.27 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108893 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0237  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  27.6 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1988  FAD-binding 9, siderophore-interacting  32.45 
 
 
285 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2034  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  32.45 
 
 
285 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870658  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3252  hypothetical protein  26.26 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2401  Siderophore-interacting protein  28.05 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000149826  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000911  utilization protein for catechol-siderophore  25.21 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>