195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09730 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_09730  siderophore-interacting protein  100 
 
 
300 aa  596  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.222844  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37330  siderophore-interacting protein  37.4 
 
 
291 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26750  siderophore-interacting protein  37.6 
 
 
296 aa  125  8.000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.27893  normal  0.341302 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1091  putative iron transport/utilisation related protein  36.26 
 
 
275 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0143564 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0023  siderophore-interacting protein  34.63 
 
 
275 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  35.11 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2693  Siderophore-interacting protein  40.08 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4193  iron utilization protein, putative  34.29 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2401  Siderophore-interacting protein  37.93 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000149826  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  33.97 
 
 
281 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0021  siderophore-interacting protein  34.73 
 
 
275 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1528  siderophore-interacting protein  34.73 
 
 
275 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1173  siderophore-interacting protein  34.73 
 
 
275 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1453  siderophore-interacting protein  34.73 
 
 
275 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0029  siderophore-interacting protein  34.73 
 
 
275 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000742042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0027  siderophore-interacting protein  34.73 
 
 
275 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0026  siderophore-interacting protein  34.73 
 
 
275 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3927  siderophore-interacting protein  33.07 
 
 
255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1056  iron-chelator utilization protein, putative  33.2 
 
 
253 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4573  siderophore-interacting protein  34.13 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  34.48 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4296  Siderophore-interacting protein  32.74 
 
 
340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000530029 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  32.8 
 
 
253 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1086  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  32.39 
 
 
252 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1856  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  35.18 
 
 
283 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0769877  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2699  siderophore-interacting protein  39.67 
 
 
304 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.295882  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3586  Siderophore-interacting protein  33.99 
 
 
279 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5136  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  32.44 
 
 
278 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.509715  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3477  Siderophore-interacting protein  32.8 
 
 
289 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5308  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  33.46 
 
 
270 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4356  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  32.79 
 
 
253 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  30.6 
 
 
284 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1901  siderophore-interacting protein  30.66 
 
 
366 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  33.59 
 
 
247 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0912  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  35.37 
 
 
274 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0336  siderophore-interacting protein  32.7 
 
 
361 aa  102  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5976  iron transport/utilisation related protein  30.91 
 
 
280 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5142  FAD-binding 9, siderophore-interacting  32.4 
 
 
273 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5717  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  32.4 
 
 
273 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3804  siderophore-interacting protein  33.2 
 
 
277 aa  99.8  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48919  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4986  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  32 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3427  siderophore-interacting protein  33.6 
 
 
277 aa  98.6  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0328876  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4522  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  32.26 
 
 
273 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45393  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1860  iron-chelator utilization protein  33.71 
 
 
273 aa  95.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0096  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  27.44 
 
 
248 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0091  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  27.17 
 
 
250 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2724  Siderophore-interacting protein  37.56 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  28.67 
 
 
281 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  27.08 
 
 
248 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3129  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  32 
 
 
273 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3380  siderophore-interacting protein  30.16 
 
 
272 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384925  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3163  siderophore-interacting protein  31.45 
 
 
273 aa  93.2  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1918  siderophore-interacting protein  31.45 
 
 
257 aa  92.4  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149107  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0871  siderophore-interacting protein  29.48 
 
 
247 aa  92.4  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314795  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2810  FAD-binding 9, siderophore-interacting  34.65 
 
 
348 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.445177  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4255  siderophore-interacting protein  28 
 
 
250 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3787  Siderophore-interacting protein  32.51 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271751 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1126  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.8 
 
 
271 aa  90.5  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.382701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4373  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  29.67 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0726253  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3532  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.52 
 
 
257 aa  90.1  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400944  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0099  siderophore-interacting protein  28 
 
 
252 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0127  siderophore-interacting protein  35.15 
 
 
266 aa  89.4  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.636914  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0076  siderophore-interacting protein  28.4 
 
 
251 aa  89.7  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06920  hypothetical protein  27.47 
 
 
272 aa  89.4  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0094  siderophore-interacting protein  28 
 
 
250 aa  89  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000911  utilization protein for catechol-siderophore  28.74 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3016  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  36.7 
 
 
275 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0096  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  27.6 
 
 
247 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3043  siderophore-interacting protein  33.03 
 
 
623 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2448  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.6 
 
 
256 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1159  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.41 
 
 
281 aa  86.3  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139634  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0363  Siderophore-interacting protein  31.1 
 
 
265 aa  85.5  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1323  Siderophore-interacting protein  35.68 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13510  siderophore-interacting protein  29.07 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2126  FAD-binding 9, siderophore-interacting  29.72 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00704936  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3524  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  36.75 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.326071  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0237  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.58 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0313  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  30 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587893  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2184  siderophore-interacting protein  28.42 
 
 
246 aa  84  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249595  normal  0.170908 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1592  Siderophore-interacting protein  32.22 
 
 
259 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0634  FAD-binding 9, siderophore-interacting  29.76 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3789  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  30.45 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20830  siderophore-interacting protein  33.33 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.93855  normal  0.0153538 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0424  Siderophore-interacting protein  28.28 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.625757 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2442  Siderophore-interacting protein  31.41 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.402244  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21440  siderophore-interacting protein  35.42 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.522532  normal  0.530536 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3144  siderophore-interacting protein  30.43 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3695  Siderophore-interacting protein  33.33 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3561  Siderophore-interacting protein  31.33 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4656  Siderophore-interacting protein  43.38 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0888  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.39 
 
 
279 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2566  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  30.07 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2366  Siderophore-interacting protein  34.08 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.277442  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1773  siderophore-interacting protein  34.24 
 
 
354 aa  77  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0112  Siderophore-interacting protein  31.76 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03709  hypothetical protein  29.52 
 
 
277 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2173  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.04 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0791652  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2998  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.63 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0124793  normal  0.0292007 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0118  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  31.7 
 
 
370 aa  75.9  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4174  Siderophore-interacting protein  32.81 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>