More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1477 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1477  tyrosine protein kinase  100 
 
 
492 aa  978    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0426268  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1234  serine/threonine protein kinase  34.47 
 
 
539 aa  128  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2621  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
419 aa  125  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0794  serine/threonine protein kinase  32.23 
 
 
623 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.779291  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0809  protein kinase  32.23 
 
 
623 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.386876  normal  0.0684467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0789  protein kinase  32.23 
 
 
621 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1394  serine/threonine protein kinase  31.48 
 
 
790 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0641845  normal  0.195915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1209  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.43 
 
 
557 aa  113  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5007  serine/threonine protein kinase  30.84 
 
 
430 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0107598  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5095  serine/threonine protein kinase  30.84 
 
 
430 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0903358  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5388  serine/threonine protein kinase  30.84 
 
 
431 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0418961  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.46 
 
 
438 aa  109  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1172  protein kinase  32.97 
 
 
451 aa  110  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.190918  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0335  serine/threonine protein kinase  31.23 
 
 
671 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656897  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  32.94 
 
 
1358 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  27.92 
 
 
583 aa  104  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4317  serine/threonine protein kinase  31.03 
 
 
587 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4403  protein kinase  31.03 
 
 
587 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12123  transmembrane serine/threonine-protein kinase J pknJ  33.8 
 
 
589 aa  103  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0224799  normal  0.854648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5635  protein kinase  31.88 
 
 
467 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4697  protein kinase  31.01 
 
 
587 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3873  serine/threonine protein kinase  27.53 
 
 
545 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  27.27 
 
 
586 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5526  serine/threonine protein kinase  33.08 
 
 
576 aa  100  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.539423 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5928  protein kinase  33.08 
 
 
576 aa  100  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3104  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.95 
 
 
659 aa  97.4  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0801  serine/threonine protein kinase  29.74 
 
 
471 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12928  transmembrane serine/threonine-protein kinase I pknI  29.55 
 
 
585 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00758832  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3427  protein kinase  35.9 
 
 
450 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11764  anchored-membrane serine/threonine-protein kinase pknF  31 
 
 
476 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0058328 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1582  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.79 
 
 
527 aa  92  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.278866  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1108  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.47 
 
 
806 aa  92  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.461598  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.77 
 
 
863 aa  90.9  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  31.71 
 
 
1108 aa  90.1  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2994  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.23 
 
 
477 aa  90.1  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.460632  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  26.17 
 
 
938 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4009  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.65 
 
 
459 aa  88.2  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270992  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5210  protein kinase  32.7 
 
 
484 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.706385  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0927  serine/threonine protein kinase  29.18 
 
 
553 aa  87.8  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.78 
 
 
645 aa  87.4  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2534  serine/threonine protein kinase  28.99 
 
 
530 aa  87  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  29.18 
 
 
502 aa  86.7  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0782  serine/threonine protein kinase  28.17 
 
 
604 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0797  protein kinase  28.17 
 
 
604 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0778  protein kinase  28.17 
 
 
604 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  24.36 
 
 
625 aa  84.7  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.86 
 
 
520 aa  84.3  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2528  serine/threonine protein kinase  32.2 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00115723  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4391  Serine/threonine protein kinase  28.34 
 
 
546 aa  84  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000198345 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.08 
 
 
598 aa  84  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.66 
 
 
1023 aa  84  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.87 
 
 
584 aa  84  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5558  protein kinase  31.8 
 
 
518 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.703459  normal  0.759172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1674  protein kinase  29.55 
 
 
1167 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  31.14 
 
 
1018 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7168  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.644589  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  28.85 
 
 
599 aa  83.6  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3912  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.09 
 
 
574 aa  83.2  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.28 
 
 
822 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4693  protein kinase  28.57 
 
 
574 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2026  protein kinase  27.21 
 
 
561 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.399882  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  27.09 
 
 
617 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  25.64 
 
 
746 aa  81.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  26.49 
 
 
776 aa  81.3  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5408  serine/threonine protein kinase  27.45 
 
 
622 aa  80.9  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212471  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.47 
 
 
878 aa  80.5  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  28.34 
 
 
571 aa  80.5  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4240  serine/threonine protein kinase  32.11 
 
 
541 aa  80.5  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271806  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3106  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.47 
 
 
518 aa  80.5  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11292  transmembrane serine/threonine-protein kinase H pknH  25 
 
 
626 aa  80.1  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000374937  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  26.24 
 
 
1053 aa  80.1  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  29.86 
 
 
672 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.46 
 
 
635 aa  78.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0720  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.68 
 
 
584 aa  78.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.92 
 
 
700 aa  78.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  26.17 
 
 
455 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  31.14 
 
 
776 aa  78.2  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6090  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
706 aa  77.4  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  26.25 
 
 
673 aa  77  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4263  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.91 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1820  serine/threonine protein kinase  30.41 
 
 
451 aa  76.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.672727  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25 
 
 
798 aa  76.6  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  29.36 
 
 
614 aa  76.6  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2110  serine/threonine protein kinase  31.28 
 
 
451 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  26.91 
 
 
1057 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14290  serine/threonine protein kinase  28.64 
 
 
723 aa  76.6  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275627  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.27 
 
 
499 aa  76.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2040  serine/threonine protein kinase  31.28 
 
 
451 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00475654  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.75 
 
 
607 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  28.36 
 
 
593 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2805  serine/threonine kinase protein  28.77 
 
 
1157 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1404  serine/threonine protein kinase  29.76 
 
 
716 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0507  serine/threonine protein kinase  30.11 
 
 
569 aa  74.7  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.672124  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.88 
 
 
676 aa  74.3  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4392  serine/threonine protein kinase  31.98 
 
 
891 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1066  protein kinase  31.43 
 
 
486 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  27.7 
 
 
468 aa  74.3  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  27 
 
 
666 aa  74.3  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1553  serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.39 
 
 
681 aa  73.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>