102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3090 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3090  protein of unknown function DUF445  100 
 
 		 421 aa  847    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000113555  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1171  protein of unknown function DUF445  94.88 
 
 		 421 aa  739    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.23014e-26 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3542  hypothetical protein  63.57 
 
 		 420 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0227  hypothetical protein  55.5 
 
 		 419 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  unclonable  1.0640799999999999e-22 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3026  protein of unknown function DUF445  55.5 
 
 		 420 aa  474  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5378  protein of unknown function DUF445  40.52 
 
 		 429 aa  289  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.240077 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3726  hypothetical protein  39.71 
 
 		 430 aa  285  8e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4919  putative inner membrane protein  40.53 
 
 		 423 aa  279  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.346159  normal  0.443006 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4921  hypothetical protein  40.53 
 
 		 423 aa  279  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.192756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4847  putative inner membrane protein  40.53 
 
 		 423 aa  279  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4871  hypothetical protein  40.53 
 
 		 423 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4773  hypothetical protein  40.26 
 
 		 423 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0507  hypothetical protein  39.53 
 
 		 432 aa  278  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4938  hypothetical protein  39.52 
 
 		 426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4768  putatitve membrane protein  39.52 
 
 		 426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4883  hypothetical protein  39.52 
 
 		 426 aa  274  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.82212  normal  0.899072 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1234  hypothetical protein  39.1 
 
 		 429 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.202183  normal  0.355956 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4564  hypothetical protein  39.28 
 
 		 426 aa  273  6e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04205  conserved inner membrane protein  40.31 
 
 		 426 aa  272  7e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.105844  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3659  protein of unknown function DUF445  40.31 
 
 		 426 aa  272  7e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00474  hypothetical protein  35.7 
 
 		 409 aa  272  7e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20187  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04168  hypothetical protein  40.31 
 
 		 426 aa  272  7e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0783971  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2464  protein of unknown function DUF445  37.11 
 
 		 430 aa  271  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.994281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2843  hypothetical protein  37.11 
 
 		 430 aa  271  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.536619  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7202  hypothetical protein  37.89 
 
 		 426 aa  269  8e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362137 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5850  hypothetical protein  39.04 
 
 		 423 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.958689 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4953  hypothetical protein  41.62 
 
 		 428 aa  266  7e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.619831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0606  hypothetical protein  34.29 
 
 		 451 aa  263  6e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1327  protein of unknown function DUF445  39.15 
 
 		 428 aa  262  8e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0453497 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0423  hypothetical protein  39.13 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0415  protein of unknown function DUF445  39.13 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2315  hypothetical protein  41.35 
 
 		 428 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3744  hypothetical protein  39.61 
 
 		 428 aa  259  8e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3671  hypothetical protein  42.01 
 
 		 428 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.798798  normal  0.653715 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5506  hypothetical protein  42.01 
 
 		 451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4584  hypothetical protein  39.12 
 
 		 428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0647128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3779  hypothetical protein  39.12 
 
 		 428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.596492  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4572  protein of unknown function DUF445  36.97 
 
 		 427 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1102  hypothetical protein  36.73 
 
 		 442 aa  249  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0495  hypothetical protein  39.38 
 
 		 428 aa  249  9e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2699  hypothetical protein  38.86 
 
 		 444 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2554  hypothetical protein  38.86 
 
 		 444 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137947  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0976  hypothetical protein  38.63 
 
 		 428 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0641  hypothetical protein  37.8 
 
 		 435 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0561  hypothetical protein  34.52 
 
 		 451 aa  236  6e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.932645  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02279  hypothetical protein  35.01 
 
 		 379 aa  236  8e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331873  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3759  hypothetical protein  34.12 
 
 		 420 aa  232  9e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.414888 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0221  hypothetical protein  34.28 
 
 		 442 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0330  protein of unknown function DUF445  36.65 
 
 		 407 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3660  protein of unknown function DUF445  33.1 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10481  transmembrane protein  32.3 
 
 		 456 aa  224  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2465  protein of unknown function DUF445  32.3 
 
 		 428 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0641  hypothetical protein  31.68 
 
 		 440 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332737  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0654  hypothetical protein  31.68 
 
 		 440 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.495865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0634  hypothetical protein  31.68 
 
 		 440 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0302528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0102  hypothetical protein  32.7 
 
 		 428 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0806  hypothetical protein  33.26 
 
 		 447 aa  216  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0772  protein of unknown function DUF445  33.64 
 
 		 445 aa  216  8e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0622  protein of unknown function DUF445  32.55 
 
 		 412 aa  212  7.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4743  hypothetical protein  32.39 
 
 		 423 aa  210  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  0.53724 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0542  protein of unknown function DUF445  30.42 
 
 		 449 aa  210  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0836  protein of unknown function DUF445  31.91 
 
 		 453 aa  206  5e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1763  hypothetical protein  31.88 
 
 		 417 aa  204  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0030  hypothetical protein  30.79 
 
 		 425 aa  203  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29018  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0473  hypothetical protein  30.34 
 
 		 421 aa  202  9e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0319  hypothetical protein  30.73 
 
 		 446 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6776  protein of unknown function DUF445  31.26 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349054  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02420  predicted membrane protein  29.86 
 
 		 427 aa  196  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.906316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0657  protein of unknown function DUF445  33.1 
 
 		 426 aa  196  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01710  predicted membrane protein  31.58 
 
 		 425 aa  186  7e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1566  hypothetical protein  32.77 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0261857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2381  hypothetical protein  29.95 
 
 		 431 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4691  protein of unknown function DUF445  30.19 
 
 		 430 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4582  hypothetical protein  32.51 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790013  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2863  hypothetical protein  30.62 
 
 		 433 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0677872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1692  hypothetical protein  31.23 
 
 		 420 aa  180  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0297982  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0038  hypothetical protein  31.57 
 
 		 401 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16810  predicted membrane protein  29.53 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.920314  normal  0.0495417 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1309  protein of unknown function DUF445  34.04 
 
 		 424 aa  168  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0899  protein of unknown function DUF445  26.95 
 
 		 417 aa  146  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000836481  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2056  hypothetical protein  32.04 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0262508  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1387  hypothetical protein  39.48 
 
 		 491 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3307  protein of unknown function DUF445  29.48 
 
 		 437 aa  139  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0383951  normal  0.0408752 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1986  protein of unknown function DUF445  26.87 
 
 		 345 aa  136  7.000000000000001e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1601  hypothetical protein  24.66 
 
 		 415 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.661113  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1654  hypothetical protein  23.97 
 
 		 415 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000922298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1785  hypothetical protein  24.1 
 
 		 400 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.651448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1834  hypothetical protein  23.97 
 
 		 415 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1632  hypothetical protein  23.97 
 
 		 415 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0643525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1908  hypothetical protein  24.34 
 
 		 415 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00182785  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1856  hypothetical protein  24.89 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.125327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1651  hypothetical protein  23.97 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3544  hypothetical protein  23.87 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1797  hypothetical protein  23.87 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.747365  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1421  hypothetical protein  23.21 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0105  membrane protein-like  28 
 
 		 272 aa  113  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1583  hypothetical protein  40.35 
 
 		 182 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4525  protein of unknown function DUF445  27.71 
 
 		 407 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000070916  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2347  protein of unknown function DUF445  23.06 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1998  protein of unknown function DUF445  23.34 
 
 		 447 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>