101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3726 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04205  conserved inner membrane protein  93.9 
 
 		 426 aa  795    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.105844  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3659  protein of unknown function DUF445  93.9 
 
 		 426 aa  795    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0507  hypothetical protein  81.52 
 
 		 432 aa  691    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4564  hypothetical protein  94.37 
 
 		 426 aa  799    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4938  hypothetical protein  93.66 
 
 		 426 aa  795    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3726  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  863    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4883  hypothetical protein  94.13 
 
 		 426 aa  798    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.82212  normal  0.899072 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4768  putatitve membrane protein  94.6 
 
 		 426 aa  800    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4871  hypothetical protein  90.07 
 
 		 423 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4921  hypothetical protein  90.5 
 
 		 423 aa  767    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.192756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4773  hypothetical protein  90.07 
 
 		 423 aa  768    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4847  putative inner membrane protein  90.31 
 
 		 423 aa  769    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4919  putative inner membrane protein  90.31 
 
 		 423 aa  769    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.346159  normal  0.443006 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5850  hypothetical protein  93.19 
 
 		 423 aa  783    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.958689 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04168  hypothetical protein  93.9 
 
 		 426 aa  795    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0783971  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5378  protein of unknown function DUF445  54.46 
 
 		 429 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.240077 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1234  hypothetical protein  55.32 
 
 		 429 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.202183  normal  0.355956 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7202  hypothetical protein  53.43 
 
 		 426 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362137 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0495  hypothetical protein  53.61 
 
 		 428 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0976  hypothetical protein  52.51 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2699  hypothetical protein  52.76 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2554  hypothetical protein  52.76 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137947  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4953  hypothetical protein  52.51 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.619831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5506  hypothetical protein  50.84 
 
 		 451 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3671  hypothetical protein  51.07 
 
 		 428 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.798798  normal  0.653715 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2315  hypothetical protein  50.75 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4584  hypothetical protein  50.5 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0647128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3779  hypothetical protein  50.5 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.596492  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3744  hypothetical protein  50.5 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0415  protein of unknown function DUF445  47.2 
 
 		 452 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0641  hypothetical protein  48.9 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0423  hypothetical protein  47.2 
 
 		 452 aa  398  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1102  hypothetical protein  45.65 
 
 		 442 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4572  protein of unknown function DUF445  46.45 
 
 		 427 aa  375  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02279  hypothetical protein  38.75 
 
 		 379 aa  288  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331873  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3542  hypothetical protein  38.98 
 
 		 420 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3090  protein of unknown function DUF445  39.71 
 
 		 421 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000113555  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3026  protein of unknown function DUF445  36.21 
 
 		 420 aa  261  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0227  hypothetical protein  36.45 
 
 		 419 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  unclonable  1.0640799999999999e-22 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1171  protein of unknown function DUF445  38.92 
 
 		 421 aa  253  6e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.23014e-26 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00474  hypothetical protein  36.56 
 
 		 409 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20187  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2464  protein of unknown function DUF445  37.4 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.994281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2843  hypothetical protein  37.4 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.536619  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1387  hypothetical protein  52.42 
 
 		 491 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0330  protein of unknown function DUF445  35.54 
 
 		 407 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02420  predicted membrane protein  33.17 
 
 		 427 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.906316 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1327  protein of unknown function DUF445  35.48 
 
 		 428 aa  209  7e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0453497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2465  protein of unknown function DUF445  33.56 
 
 		 428 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1763  hypothetical protein  31.92 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0319  hypothetical protein  30.66 
 
 		 446 aa  203  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0030  hypothetical protein  32.13 
 
 		 425 aa  202  7e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29018  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0641  hypothetical protein  31.44 
 
 		 440 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332737  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0654  hypothetical protein  31.44 
 
 		 440 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.495865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0634  hypothetical protein  31.21 
 
 		 440 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0302528 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0542  protein of unknown function DUF445  30.82 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0606  hypothetical protein  32.85 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10481  transmembrane protein  31.37 
 
 		 456 aa  196  6e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6776  protein of unknown function DUF445  32.31 
 
 		 418 aa  196  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349054  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0221  hypothetical protein  32.28 
 
 		 442 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0102  hypothetical protein  33.18 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3759  hypothetical protein  30.64 
 
 		 420 aa  191  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.414888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0657  protein of unknown function DUF445  34.37 
 
 		 426 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0622  protein of unknown function DUF445  28.91 
 
 		 412 aa  184  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0561  hypothetical protein  31.68 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.932645  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3660  protein of unknown function DUF445  28.71 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0806  hypothetical protein  30.68 
 
 		 447 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01710  predicted membrane protein  31.76 
 
 		 425 aa  180  4.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1692  hypothetical protein  32.13 
 
 		 420 aa  179  7e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0297982  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4743  hypothetical protein  31.43 
 
 		 423 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  0.53724 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0836  protein of unknown function DUF445  30.07 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2381  hypothetical protein  30.48 
 
 		 431 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1583  hypothetical protein  54.39 
 
 		 182 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0473  hypothetical protein  30.77 
 
 		 421 aa  169  8e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4582  hypothetical protein  30.5 
 
 		 404 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790013  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0772  protein of unknown function DUF445  28 
 
 		 445 aa  163  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1566  hypothetical protein  29.02 
 
 		 400 aa  162  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0261857 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2056  hypothetical protein  30.75 
 
 		 425 aa  159  8e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0262508  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2863  hypothetical protein  28.99 
 
 		 433 aa  157  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0677872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4691  protein of unknown function DUF445  28.27 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1309  protein of unknown function DUF445  30.37 
 
 		 424 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0038  hypothetical protein  30.79 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16810  predicted membrane protein  30.57 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.920314  normal  0.0495417 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3307  protein of unknown function DUF445  30.37 
 
 		 437 aa  143  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0383951  normal  0.0408752 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0899  protein of unknown function DUF445  24.28 
 
 		 417 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000836481  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1986  protein of unknown function DUF445  24.94 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0105  membrane protein-like  28.57 
 
 		 272 aa  114  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1998  protein of unknown function DUF445  22.27 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1421  hypothetical protein  20.95 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1856  hypothetical protein  21.75 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.125327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4524  protein of unknown function DUF445  23.08 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104757  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1797  hypothetical protein  22.5 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.747365  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1651  hypothetical protein  23.89 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1908  hypothetical protein  23.65 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00182785  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3544  hypothetical protein  23.65 
 
 		 415 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1601  hypothetical protein  21.5 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.661113  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1654  hypothetical protein  21.28 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000922298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1785  hypothetical protein  21.28 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.651448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1834  hypothetical protein  21.28 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1632  hypothetical protein  22.19 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0643525  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2347  protein of unknown function DUF445  21.34 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>