101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0105 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0030  hypothetical protein  99.63 
 
 
425 aa  544  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29018  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0105  membrane protein-like  100 
 
 
272 aa  541  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0473  hypothetical protein  35.34 
 
 
421 aa  177  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4743  hypothetical protein  31 
 
 
423 aa  145  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  0.53724 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1763  hypothetical protein  28.31 
 
 
417 aa  145  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0330  protein of unknown function DUF445  31.05 
 
 
407 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5378  protein of unknown function DUF445  30.21 
 
 
429 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.240077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4691  protein of unknown function DUF445  29.41 
 
 
430 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1234  hypothetical protein  30.74 
 
 
429 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.202183  normal  0.355956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2465  protein of unknown function DUF445  31.03 
 
 
428 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0622  protein of unknown function DUF445  29.04 
 
 
412 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3026  protein of unknown function DUF445  28.15 
 
 
420 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02420  predicted membrane protein  29.62 
 
 
427 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.906316 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7202  hypothetical protein  31.23 
 
 
426 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362137 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0038  hypothetical protein  30.47 
 
 
401 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0542  protein of unknown function DUF445  29.1 
 
 
449 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6776  protein of unknown function DUF445  30.61 
 
 
418 aa  125  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349054  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00474  hypothetical protein  28.98 
 
 
409 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20187  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3759  hypothetical protein  29.32 
 
 
420 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.414888 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0319  hypothetical protein  28.81 
 
 
446 aa  122  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1692  hypothetical protein  29 
 
 
420 aa  122  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0297982  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0227  hypothetical protein  26.3 
 
 
419 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  unclonable  1.0640799999999999e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0423  hypothetical protein  30.9 
 
 
452 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0415  protein of unknown function DUF445  30.9 
 
 
452 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0221  hypothetical protein  28.62 
 
 
442 aa  118  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4572  protein of unknown function DUF445  29.33 
 
 
427 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0657  protein of unknown function DUF445  32.93 
 
 
426 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4564  hypothetical protein  29.23 
 
 
426 aa  116  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4768  putatitve membrane protein  29.23 
 
 
426 aa  115  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04205  conserved inner membrane protein  29.23 
 
 
426 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.105844  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3659  protein of unknown function DUF445  29.23 
 
 
426 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4938  hypothetical protein  29.23 
 
 
426 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4883  hypothetical protein  29.23 
 
 
426 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.82212  normal  0.899072 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04168  hypothetical protein  29.23 
 
 
426 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0783971  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4582  hypothetical protein  30.71 
 
 
404 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3726  hypothetical protein  28.57 
 
 
430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4871  hypothetical protein  28.42 
 
 
423 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0836  protein of unknown function DUF445  29.08 
 
 
453 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0641  hypothetical protein  30.94 
 
 
435 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4921  hypothetical protein  28.42 
 
 
423 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.192756  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4773  hypothetical protein  28.42 
 
 
423 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4847  putative inner membrane protein  28.42 
 
 
423 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4919  putative inner membrane protein  28.42 
 
 
423 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.346159  normal  0.443006 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10481  transmembrane protein  27.86 
 
 
456 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0606  hypothetical protein  29.37 
 
 
451 aa  110  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5850  hypothetical protein  28.87 
 
 
423 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.958689 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0507  hypothetical protein  26.13 
 
 
432 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1102  hypothetical protein  27.87 
 
 
442 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0634  hypothetical protein  25.83 
 
 
440 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0302528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1566  hypothetical protein  28.74 
 
 
400 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0261857 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0772  protein of unknown function DUF445  27.1 
 
 
445 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2464  protein of unknown function DUF445  28.26 
 
 
430 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.994281  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2843  hypothetical protein  28.26 
 
 
430 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.536619  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0641  hypothetical protein  25.46 
 
 
440 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332737  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0654  hypothetical protein  25.46 
 
 
440 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.495865  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3542  hypothetical protein  25.44 
 
 
420 aa  105  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02279  hypothetical protein  24.65 
 
 
379 aa  102  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331873  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2381  hypothetical protein  27.68 
 
 
431 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116042  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16810  predicted membrane protein  26.3 
 
 
395 aa  101  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.920314  normal  0.0495417 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1327  protein of unknown function DUF445  29.03 
 
 
428 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0453497 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01710  predicted membrane protein  28.86 
 
 
425 aa  100  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0806  hypothetical protein  26.94 
 
 
447 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3660  protein of unknown function DUF445  26.2 
 
 
435 aa  99.8  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3090  protein of unknown function DUF445  28 
 
 
421 aa  99  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000113555  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1986  protein of unknown function DUF445  26.02 
 
 
345 aa  94.7  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0102  hypothetical protein  25.83 
 
 
428 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0561  hypothetical protein  30.21 
 
 
451 aa  93.2  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.932645  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2315  hypothetical protein  28.89 
 
 
428 aa  92.8  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1998  protein of unknown function DUF445  22.71 
 
 
447 aa  92.4  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3671  hypothetical protein  29.26 
 
 
428 aa  92.4  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.798798  normal  0.653715 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1171  protein of unknown function DUF445  27.07 
 
 
421 aa  92  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.23014e-26 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0495  hypothetical protein  26.92 
 
 
428 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2863  hypothetical protein  26.3 
 
 
433 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0677872  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5506  hypothetical protein  28.89 
 
 
451 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430298  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3744  hypothetical protein  29.26 
 
 
428 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2554  hypothetical protein  27.21 
 
 
444 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137947  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2699  hypothetical protein  27.21 
 
 
444 aa  89.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4584  hypothetical protein  28.89 
 
 
428 aa  89  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0647128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3779  hypothetical protein  28.89 
 
 
428 aa  89  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.596492  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0976  hypothetical protein  26.84 
 
 
428 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1309  protein of unknown function DUF445  30.49 
 
 
424 aa  87.8  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4953  hypothetical protein  28.52 
 
 
428 aa  86.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.619831  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0899  protein of unknown function DUF445  27.96 
 
 
417 aa  86.3  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000836481  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2056  hypothetical protein  24.82 
 
 
425 aa  85.1  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0262508  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3307  protein of unknown function DUF445  26.53 
 
 
437 aa  83.2  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0383951  normal  0.0408752 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1583  hypothetical protein  29.01 
 
 
182 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4524  protein of unknown function DUF445  22.58 
 
 
432 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104757  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1421  hypothetical protein  33.33 
 
 
415 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1785  hypothetical protein  27.47 
 
 
400 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.651448  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1654  hypothetical protein  27.47 
 
 
415 aa  59.3  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000922298  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1601  hypothetical protein  28.57 
 
 
415 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.661113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1834  hypothetical protein  27.47 
 
 
415 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1632  hypothetical protein  28.57 
 
 
415 aa  59.3  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0643525  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1651  hypothetical protein  28.57 
 
 
415 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1797  hypothetical protein  28.57 
 
 
415 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.747365  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3544  hypothetical protein  27.38 
 
 
415 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1856  hypothetical protein  27.59 
 
 
415 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.125327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1908  hypothetical protein  26.37 
 
 
415 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00182785  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4525  protein of unknown function DUF445  28.74 
 
 
407 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000070916  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2347  protein of unknown function DUF445  19.37 
 
 
422 aa  56.2  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>