More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3578 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3578  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
298 aa  594  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197297 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1720  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.6 
 
 
409 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4525  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.6 
 
 
409 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.517886  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1870  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.01 
 
 
404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4199  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.38 
 
 
361 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.766711  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4581  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.52 
 
 
404 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6052  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.78 
 
 
404 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415837  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0913  transposase IS116/IS110/IS902  29.92 
 
 
406 aa  96.7  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1808  transposase IS116/IS110/IS902  29.92 
 
 
406 aa  96.7  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10850  transposase  30.04 
 
 
405 aa  87  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.480792  unclonable  0.00000000306123 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5103  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.39 
 
 
414 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116678  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0480  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.57 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.26 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0506818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2024  transposase IS116/IS110/IS902  24 
 
 
396 aa  77  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000259984  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1034  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26.02 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000872071  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2868  transposase IS116/IS110/IS902  24.81 
 
 
418 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.666774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1942  transposase, IS110 family, OrfB  24.07 
 
 
411 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.245444  normal  0.115147 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2850  transposase IS116/IS110/IS902  24.6 
 
 
418 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.516093  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1983  transposase IS116/IS110/IS902  24.6 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1228  transposase  31.97 
 
 
326 aa  65.5  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0655964  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4472  IS621, transposase  31.97 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4386  IS621, transposase  31.97 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4419  IS621, transposase  31.97 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4700  IS621, transposase  31.97 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4815  IS621, transposase  31.97 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1814  IS621, transposase  31.97 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1120  IS621, transposase  31.97 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4118  IS621, transposase  31.97 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3109  IS621, transposase  31.97 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0419  IS621, transposase  31.97 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0196  IS621, transposase  31.97 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878007  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0878  IS621, transposase  31.97 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0718  IS621, transposase  31.97 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000540983  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2567  IS621, transposase  31.97 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1035  IS621, transposase  31.97 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.709382  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3002  IS621, transposase  31.97 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4039  IS621, transposase  31.97 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1971  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.05 
 
 
411 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0214009  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4179  IS621, transposase  31.97 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0005  IS621, transposase  31.97 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.854592  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0891  IS621, transposase  31.97 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.732659  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2223  transposase, IS110 family, OrfA  23.33 
 
 
412 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92844e-48 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4498  IS621, transposase  31.97 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3066  transposase  23.05 
 
 
411 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000892616  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3457  IS621, transposase  32.19 
 
 
326 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0198  IS621, transposase  32.19 
 
 
326 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.410947  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2723  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  26 
 
 
393 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2733  IS621, transposase  31.97 
 
 
326 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0780599  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4477  IS621, transposase  31.51 
 
 
327 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219799  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4200  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.33 
 
 
401 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1120  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.67 
 
 
328 aa  62.8  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0932183  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0375  transposase IS116/IS110/IS902  30.33 
 
 
401 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3502  transposase IS116/IS110/IS902  30.33 
 
 
401 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4926  transposase IS116/IS110/IS902  30.33 
 
 
401 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5506  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.33 
 
 
401 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281542 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5513  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.33 
 
 
401 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  unclonable  0.000000000996402  decreased coverage  0.00000000098172 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5520  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.33 
 
 
401 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240252  hitchhiker  0.0000000689904 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5526  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.33 
 
 
401 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112316  hitchhiker  0.000000304553 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5538  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.33 
 
 
401 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.25664  hitchhiker  0.000556456 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4091  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.33 
 
 
401 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0416  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.33 
 
 
401 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1737  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.33 
 
 
401 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1353  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.39 
 
 
382 aa  62  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1635  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.39 
 
 
382 aa  62  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2015  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.78 
 
 
427 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.792556  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1826  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.78 
 
 
427 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.508781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1449  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.78 
 
 
427 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2829  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.78 
 
 
427 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1351  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.78 
 
 
427 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000796647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0857  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.78 
 
 
427 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0349  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.78 
 
 
427 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.248005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0850  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  22.78 
 
 
427 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.884754  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1558  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.97 
 
 
420 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000508366  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1045  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.97 
 
 
420 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1515  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.97 
 
 
420 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1995  IS110 family transposase  26.74 
 
 
337 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00496148  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1556  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30 
 
 
328 aa  61.2  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00019648  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.97 
 
 
420 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0012  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30 
 
 
328 aa  61.2  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1950  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.97 
 
 
420 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0644  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.97 
 
 
420 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1195  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.97 
 
 
420 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1259  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.97 
 
 
420 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.293497  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0527  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  23.97 
 
 
420 aa  61.6  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1544  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  24.91 
 
 
424 aa  60.1  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00314291  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0276  prophage LambdaW1, IS110 family transposase  31.69 
 
 
340 aa  59.7  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.290854  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0408  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.33 
 
 
326 aa  60.1  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000108361  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2882  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.93 
 
 
321 aa  59.3  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3243  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.93 
 
 
321 aa  59.3  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1820  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.93 
 
 
321 aa  59.3  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.161882  normal  0.193325 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1633  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.93 
 
 
321 aa  59.3  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0380198  normal  0.28668 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2268  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.93 
 
 
321 aa  59.3  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1462  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  28.93 
 
 
321 aa  59.3  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2068  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.33 
 
 
330 aa  58.9  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.33 
 
 
330 aa  58.9  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1707  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.33 
 
 
330 aa  58.9  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.29722 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1687  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.06 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.133517 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0984  hypothetical protein  28.21 
 
 
326 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0228  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.06 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.596034  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0809  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.06 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>