14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2002 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2002  protease domain-containing protein  100 
 
 		 166 aa  320  8e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5405  hypothetical protein  55.76 
 
 		 147 aa  158  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400944  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0091  hypothetical protein  51.81 
 
 		 158 aa  150  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0094  hypothetical protein  52.41 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6691  integral membrane protein  50.9 
 
 		 147 aa  133  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3432  hypothetical protein  70.37 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3477  hypothetical protein  36.31 
 
 		 162 aa  84.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000229905  normal  0.0132004 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2395  hypothetical protein  38.38 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.687909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3788  membrane protein-like protein  35.71 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.739425  hitchhiker  0.00349286 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3429  putative integral membrane protein  44.66 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8562  hypothetical protein  32.28 
 
 		 141 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1895  hypothetical protein  31.45 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0820  putative integral membrane protein  28.31 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3116  hypothetical protein  29.53 
 
 		 149 aa  41.2  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148281 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>