15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6691 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6691  integral membrane protein  100 
 
 
147 aa  280  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5405  hypothetical protein  57.14 
 
 
147 aa  158  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400944  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2002  protease domain-containing protein  52.69 
 
 
166 aa  143  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0091  hypothetical protein  52.9 
 
 
158 aa  142  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0094  hypothetical protein  54.19 
 
 
158 aa  140  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3788  membrane protein-like protein  44.37 
 
 
149 aa  93.6  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.739425  hitchhiker  0.00349286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3477  hypothetical protein  40.74 
 
 
162 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000229905  normal  0.0132004 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2395  hypothetical protein  41.32 
 
 
169 aa  85.1  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.687909 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3432  hypothetical protein  55.26 
 
 
96 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8562  hypothetical protein  34.01 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725664  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3429  putative integral membrane protein  39.6 
 
 
103 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1895  hypothetical protein  32.65 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1052  hypothetical protein  31.9 
 
 
162 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.321975  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3116  hypothetical protein  33.09 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148281 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3909  hypothetical protein  28.48 
 
 
153 aa  42.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.341438  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>