13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1895 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1895  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  283  5.999999999999999e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8562  hypothetical protein  54.41 
 
 
141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725664  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3116  hypothetical protein  56.82 
 
 
149 aa  130  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148281 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1052  hypothetical protein  43.48 
 
 
162 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.321975  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0820  putative integral membrane protein  30.87 
 
 
169 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0091  hypothetical protein  36.91 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3909  hypothetical protein  32.21 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.341438  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0094  hypothetical protein  38.26 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5405  hypothetical protein  34.51 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400944  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3788  membrane protein-like protein  31.72 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.739425  hitchhiker  0.00349286 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2002  protease domain-containing protein  30.19 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3477  hypothetical protein  33.13 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000229905  normal  0.0132004 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6691  integral membrane protein  31.29 
 
 
147 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.221391 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>