16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5405 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5405  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  284  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400944  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2002  protease domain-containing protein  54.55 
 
 		 166 aa  155  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6691  integral membrane protein  57.14 
 
 		 147 aa  150  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0091  hypothetical protein  52.26 
 
 		 158 aa  147  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0094  hypothetical protein  51.61 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3432  hypothetical protein  61.84 
 
 		 96 aa  88.2  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3477  hypothetical protein  35.93 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000229905  normal  0.0132004 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3788  membrane protein-like protein  40 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.739425  hitchhiker  0.00349286 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2395  hypothetical protein  37.57 
 
 		 169 aa  80.1  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.687909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8562  hypothetical protein  34.29 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1895  hypothetical protein  34.51 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1052  hypothetical protein  30.38 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.321975  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3429  putative integral membrane protein  38.24 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3116  hypothetical protein  32.03 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148281 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0820  putative integral membrane protein  31.29 
 
 		 169 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3909  hypothetical protein  29.8 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.341438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>