12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3788 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3788  membrane protein-like protein  100 
 
 		 149 aa  290  6e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.739425  hitchhiker  0.00349286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3477  hypothetical protein  59.63 
 
 		 162 aa  168  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000229905  normal  0.0132004 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2395  hypothetical protein  58.08 
 
 		 169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.687909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0091  hypothetical protein  44.74 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0094  hypothetical protein  42.11 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6691  integral membrane protein  43.71 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5405  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400944  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2002  protease domain-containing protein  35.71 
 
 		 166 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3432  hypothetical protein  44.93 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1895  hypothetical protein  31.08 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8562  hypothetical protein  26.03 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3429  putative integral membrane protein  64.29 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>