11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3477 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3477  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  312  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000229905  normal  0.0132004 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3788  membrane protein-like protein  59.63 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.739425  hitchhiker  0.00349286 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2395  hypothetical protein  60 
 
 		 169 aa  159  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.687909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0094  hypothetical protein  45.24 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0091  hypothetical protein  43.45 
 
 		 158 aa  111  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5405  hypothetical protein  35.93 
 
 		 147 aa  87.4  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6691  integral membrane protein  40.12 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2002  protease domain-containing protein  35.75 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3429  putative integral membrane protein  38.14 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1895  hypothetical protein  33.13 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3432  hypothetical protein  36.36 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>