15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0094 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0094  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  305  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0091  hypothetical protein  90.51 
 
 		 158 aa  280  4.0000000000000003e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2002  protease domain-containing protein  51.81 
 
 		 166 aa  144  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5405  hypothetical protein  51.61 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6691  integral membrane protein  54.19 
 
 		 147 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3477  hypothetical protein  45.24 
 
 		 162 aa  114  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000229905  normal  0.0132004 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3788  membrane protein-like protein  42.11 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.739425  hitchhiker  0.00349286 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2395  hypothetical protein  45.4 
 
 		 169 aa  97.1  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.687909 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3432  hypothetical protein  60.53 
 
 		 96 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1895  hypothetical protein  38.26 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8562  hypothetical protein  32.89 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0820  putative integral membrane protein  31.17 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3429  putative integral membrane protein  43.69 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3909  hypothetical protein  27.39 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.341438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3116  hypothetical protein  28.87 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148281 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>