11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8562 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8562  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  279  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725664  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3116  hypothetical protein  70.4 
 
 		 149 aa  176  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148281 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1052  hypothetical protein  48.39 
 
 		 162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.321975  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1895  hypothetical protein  52.21 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5405  hypothetical protein  34.29 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400944  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0091  hypothetical protein  34.23 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0094  hypothetical protein  32.89 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2002  protease domain-containing protein  33.33 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6691  integral membrane protein  34.01 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0820  putative integral membrane protein  27.78 
 
 		 169 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3909  hypothetical protein  28.47 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.341438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>