9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3909 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3909  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  287  4e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.341438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0820  putative integral membrane protein  49.67 
 
 		 169 aa  149  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1895  hypothetical protein  32.21 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0091  hypothetical protein  28.39 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0094  hypothetical protein  27.39 
 
 		 158 aa  47  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5405  hypothetical protein  29.8 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8562  hypothetical protein  28.47 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725664  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3116  hypothetical protein  36.08 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148281 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3400  conjugal transfer protein TrbL  33.03 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000129565  hitchhiker  0.00000763574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>