11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3116 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3116  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  288  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8562  hypothetical protein  71.43 
 
 
141 aa  187  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725664  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1895  hypothetical protein  57.14 
 
 
144 aa  130  9e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1052  hypothetical protein  49.69 
 
 
162 aa  126  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.321975  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0091  hypothetical protein  31.29 
 
 
158 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5405  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400944  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0094  hypothetical protein  29.93 
 
 
158 aa  53.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3909  hypothetical protein  28.95 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.341438  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0820  putative integral membrane protein  27.1 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2002  protease domain-containing protein  31.21 
 
 
166 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6691  integral membrane protein  33.1 
 
 
147 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.221391 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>