26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0419 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0419  RNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 73 aa  145  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3730  RNA-directed DNA polymerase  56.72 
 
 		 340 aa  80.1  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.70483 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1001  reverse transcriptase  56.72 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2554  reverse transcriptase  58.46 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1979  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  49.23 
 
 		 417 aa  69.3  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.312745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1129  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  49.23 
 
 		 350 aa  69.3  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.951259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0653  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  49.23 
 
 		 417 aa  69.3  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.008692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4019  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.47 
 
 		 415 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6736  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  50.82 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.328111  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3413  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  50.82 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0629  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.86 
 
 		 411 aa  51.6  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0416  RNA-directed DNA polymerase  43.75 
 
 		 413 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0963  RNA-directed DNA polymerase  43.75 
 
 		 413 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0470152  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1076  RNA-directed DNA polymerase  43.75 
 
 		 413 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722331  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1245  RNA-directed DNA polymerase  43.75 
 
 		 413 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2112  RNA-directed DNA polymerase  43.75 
 
 		 413 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4539  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  39.68 
 
 		 413 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.605782  normal  0.634482 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0275  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.19 
 
 		 354 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1481  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.84 
 
 		 418 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.251743  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0626  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40.32 
 
 		 441 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000304657  hitchhiker  0.00000002328 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2197  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  35.29 
 
 		 440 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.298068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5513  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.19 
 
 		 419 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.561681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6095  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.19 
 
 		 419 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1223  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.19 
 
 		 419 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0131896  normal  0.0593975 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4903  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.19 
 
 		 419 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.791512  normal  0.702459 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2104  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  35.94 
 
 		 413 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0282857  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>