30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4396 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4396  haloacid dehalogenase-like hydrolase, type 3  100 
 
 		 265 aa  528  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0177  hydrolase  83.59 
 
 		 266 aa  444  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0780  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase type 3  50.37 
 
 		 273 aa  249  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5567  sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase  37.04 
 
 		 272 aa  129  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2939  SPP-like hydrolase  26.82 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000389482  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1919  SPP-like hydrolase  29.79 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1251  Cof-like hydrolase  29.12 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202118  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2100  SPP-like hydrolase  27.92 
 
 		 232 aa  52.4  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1070  SPP-like hydrolase  26.25 
 
 		 228 aa  52  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0195406  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  23.97 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1945  HAD family hydrolase  25.11 
 
 		 250 aa  46.2  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.238634 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  28.24 
 
 		 268 aa  46.2  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0559  putative HAD superfamily hydrolase  25.67 
 
 		 281 aa  45.8  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0605487  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  26.36 
 
 		 285 aa  45.8  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2526  sugar phosphatase SupH  25.11 
 
 		 271 aa  45.8  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0998065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  25.11 
 
 		 271 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  25.11 
 
 		 271 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1316  Cof-like hydrolase  24.49 
 
 		 271 aa  45.4  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  25.11 
 
 		 271 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  25.11 
 
 		 271 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0893  sugar phosphatase SupH  25.11 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380533  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0041  SPP-like hydrolase  27.59 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  24.14 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  24.68 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2822  Cof-like hydrolase  24.14 
 
 		 271 aa  43.5  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0900  HAD superfamily hydrolase  21.17 
 
 		 268 aa  43.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2604  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  36.78 
 
 		 312 aa  42.7  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  22.14 
 
 		 279 aa  42.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2034  phosphoglycolate phosphatase  22.71 
 
 		 226 aa  42  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.376803  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0062  HAD superfamily hydrolase  21.13 
 
 		 270 aa  42  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>