32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0177 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0177  hydrolase  100 
 
 
266 aa  523  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4396  haloacid dehalogenase-like hydrolase, type 3  83.53 
 
 
265 aa  433  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0780  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase type 3  53.48 
 
 
273 aa  259  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5567  sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase  36.26 
 
 
272 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2939  SPP-like hydrolase  26.44 
 
 
232 aa  58.9  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000389482  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1919  SPP-like hydrolase  29.81 
 
 
234 aa  58.9  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1251  Cof-like hydrolase  25.93 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202118  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2100  SPP-like hydrolase  27.48 
 
 
232 aa  45.8  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  24.6 
 
 
265 aa  45.4  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4690  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.31 
 
 
275 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1070  SPP-like hydrolase  25.44 
 
 
228 aa  45.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0195406  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  37.31 
 
 
273 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  37.31 
 
 
273 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2774  Cof-like hydrolase  21.46 
 
 
265 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  37.31 
 
 
273 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  37.31 
 
 
273 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1335  Cof-like hydrolase  24.18 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  37.31 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3865  HAD family hydrolase  37.31 
 
 
273 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0086  Cof-like hydrolase  37.31 
 
 
280 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00811  hypothetical protein  24.39 
 
 
271 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00828  hypothetical protein  24.39 
 
 
271 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2034  phosphoglycolate phosphatase  23.58 
 
 
226 aa  43.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.376803  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  25.77 
 
 
268 aa  43.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2798  Cof-like hydrolase  24.39 
 
 
271 aa  43.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.260626  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0906  phosphatase YbjI  24.1 
 
 
271 aa  42.7  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.742575  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  35.82 
 
 
291 aa  42.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.52 
 
 
282 aa  42.4  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07610  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.52 
 
 
265 aa  42.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0517229 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2798  Cof-like hydrolase  24.39 
 
 
271 aa  42  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  0.741017 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2501  phosphatase YbjI  24.39 
 
 
271 aa  42  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0884  SPP-like hydrolase  24.15 
 
 
222 aa  42  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>