31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2893 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2893  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  531  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2002  hypothetical protein  37.84 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0318  HhH-GPD family protein  28.18 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.536275 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1557  transcriptional regulator, AraC family  34.35 
 
 		 565 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.486878  hitchhiker  0.00513105 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2940  AraC family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 565 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.91789  normal  0.0713336 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2497  alcohol dehydrogenase  29.86 
 
 		 563 aa  53.9  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4314  putative DNA repair protein  26.85 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2800  alcohol dehydrogenase  34.35 
 
 		 565 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2820  alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 		 565 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2359  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  31.07 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.904155 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2467  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  27.95 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2352  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  30.51 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2252  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  30.51 
 
 		 289 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2904  AraC family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 502 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.190431 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2505  putative transcription regulator protein  27.59 
 
 		 490 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0201165 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2022  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  19.76 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2308  3-methyl-adenine DNA glycosylase II  30.51 
 
 		 289 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3510  DNA-3-methyladenine glycosylase II  31.54 
 
 		 303 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.043579  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3127  Ada regulatory protein, putative  28.33 
 
 		 542 aa  45.8  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1432  DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  27.43 
 
 		 542 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.587102 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1367  transcriptional regulator Ada / DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  27.43 
 
 		 542 aa  45.4  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.987326  normal  0.0122052 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4073  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 505 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2163  HhH-GPD family protein  30.15 
 
 		 328 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1420  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II  29.77 
 
 		 542 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.484928 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1213  HhH-GPD  27.65 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.235749  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1452  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 503 aa  43.9  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3871  DNA-3-methyladenine glycosidase  25.6 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3753  DNA-3-methyladenine glycosidase  25.6 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000204691 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3587  DNA-3-methyladenine glycosidase  25.6 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.655108  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3766  DNA-3-methyladenine glycosylase  31.65 
 
 		 218 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0506  8-oxoguanine DNA glycosylase domain-containing protein  22.92 
 
 		 297 aa  42  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000424697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>