More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0130 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0130  transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 		 454 aa  902    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1287  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.23 
 
 		 465 aa  438  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.324635  normal  0.577676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4399  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.37 
 
 		 466 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1282  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.37 
 
 		 466 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124375  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2973  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.37 
 
 		 466 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0717724  normal  0.0172565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4398  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.37 
 
 		 466 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2042  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.37 
 
 		 466 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.198929  normal  0.0124292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2232  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.37 
 
 		 466 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000585875  normal  0.443218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0858  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.37 
 
 		 466 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.425839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0682  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.37 
 
 		 466 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0087  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.37 
 
 		 466 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0407  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.06 
 
 		 420 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2265  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.06 
 
 		 420 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.654295  normal  0.518866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3921  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.06 
 
 		 420 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.174408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4655  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.06 
 
 		 420 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4882  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.06 
 
 		 420 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2958  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.35 
 
 		 483 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3494  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.23 
 
 		 442 aa  378  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  0.207887 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.69 
 
 		 414 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000113167  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0589  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.69 
 
 		 414 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3851  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.69 
 
 		 414 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3853  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.69 
 
 		 414 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2124  transposase IS116/IS110/IS902  50.12 
 
 		 412 aa  318  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.29674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3436  transposase IS116/IS110/IS902  44.92 
 
 		 412 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1024  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.39 
 
 		 412 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2125  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.39 
 
 		 412 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2235  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.39 
 
 		 444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2366  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.39 
 
 		 412 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.587886  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3437  transposase IS116/IS110/IS902  44.68 
 
 		 412 aa  312  6.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4122  transposase IS116/IS110/IS902  44.68 
 
 		 412 aa  312  6.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1959  transposase IS116/IS110/IS902  42.02 
 
 		 420 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.945198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6342  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.18 
 
 		 408 aa  302  9e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6341  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.18 
 
 		 408 aa  302  9e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0725  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.67 
 
 		 411 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2321  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.52 
 
 		 406 aa  286  4e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.52 
 
 		 406 aa  286  4e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2322  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.52 
 
 		 406 aa  286  4e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1903  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.62 
 
 		 406 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3127  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.09 
 
 		 406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1960  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.33 
 
 		 411 aa  280  5e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.261169  normal  0.0163724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2919  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.74 
 
 		 407 aa  277  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000420337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3147  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.74 
 
 		 407 aa  277  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.166757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3050  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.74 
 
 		 407 aa  277  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3328  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.74 
 
 		 407 aa  277  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.74 
 
 		 407 aa  277  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1178  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.74 
 
 		 407 aa  277  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.71 
 
 		 402 aa  269  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5208  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.18 
 
 		 423 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0957  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.18 
 
 		 423 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1319  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.18 
 
 		 423 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.622627  normal  0.467675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5136  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.18 
 
 		 423 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.18 
 
 		 423 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127954  hitchhiker  0.00882366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2919  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.97 
 
 		 408 aa  267  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.05 
 
 		 542 aa  263  6e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.05 
 
 		 540 aa  263  6e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0989  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.05 
 
 		 540 aa  263  6e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1048  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.05 
 
 		 540 aa  263  6e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3130  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.24 
 
 		 378 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2090  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.5 
 
 		 378 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000104804  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1110  ISAfe3, transposase  36.28 
 
 		 408 aa  236  9e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0550  ISAfe3, transposase  36.28 
 
 		 408 aa  236  9e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.227474  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2709  ISAfe3, transposase  36.28 
 
 		 408 aa  236  9e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2432  ISAfe3, transposase  36.28 
 
 		 408 aa  236  9e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1142  ISAfe3, transposase  36.28 
 
 		 408 aa  236  9e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2972  ISAfe3, transposase  36.28 
 
 		 408 aa  236  9e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3263  ISAfe3, transposase  36.28 
 
 		 408 aa  236  9e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1265  ISAfe3, transposase  36.28 
 
 		 408 aa  236  9e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0134  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35 
 
 		 435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0326  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.79 
 
 		 408 aa  221  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1225  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.79 
 
 		 408 aa  221  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1735  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.79 
 
 		 408 aa  221  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.235324 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1944  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.79 
 
 		 408 aa  221  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402524  normal  0.468293 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2147  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.79 
 
 		 408 aa  221  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000616647 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3370  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.79 
 
 		 408 aa  221  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3374  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.79 
 
 		 408 aa  221  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.495996 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3377  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.79 
 
 		 408 aa  221  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.465858 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3378  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.79 
 
 		 408 aa  221  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.195678 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3403  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.79 
 
 		 408 aa  221  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0158163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3441  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.79 
 
 		 408 aa  221  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.83256 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4041  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.79 
 
 		 408 aa  221  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4042  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.79 
 
 		 408 aa  221  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14300  transposase IS116/IS110/IS902  36.43 
 
 		 392 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3223  transposase  43.16 
 
 		 248 aa  217  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0327091  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0286  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.04 
 
 		 441 aa  204  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150235  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4136  transposase  36.63 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.888803 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5544  transposase IS116/IS110/IS902  36.19 
 
 		 440 aa  200  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.362719 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1223  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  32.95 
 
 		 310 aa  196  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1133  ISPpu9, transposase  33.03 
 
 		 442 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0282142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1260  ISPpu9, transposase  33.03 
 
 		 442 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.469395 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2570  ISPpu9, transposase  33.03 
 
 		 442 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3381  ISPpu9, transposase  33.03 
 
 		 442 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3586  ISPpu9, transposase  33.03 
 
 		 442 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4603  ISPpu9, transposase  33.03 
 
 		 442 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.79364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4791  ISPpu9, transposase  33.03 
 
 		 442 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0024  transposase  34.01 
 
 		 454 aa  182  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.54 
 
 		 442 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3738  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  33.73 
 
 		 453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12452  transposase  33.88 
 
 		 333 aa  173  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.267636 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4948  transposase IS111A/IS1328/IS1533  51.34 
 
 		 188 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1407  transposase  30.24 
 
 		 414 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.31889  normal  0.364163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>