255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3223 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3223  transposase  100 
 
 
248 aa  505  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0327091  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1959  transposase IS116/IS110/IS902  81.45 
 
 
420 aa  422  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.945198  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3436  transposase IS116/IS110/IS902  61.04 
 
 
412 aa  310  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2124  transposase IS116/IS110/IS902  61.04 
 
 
412 aa  310  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.29674  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3437  transposase IS116/IS110/IS902  60.64 
 
 
412 aa  307  8e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222755  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4122  transposase IS116/IS110/IS902  60.64 
 
 
412 aa  307  8e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.82 
 
 
406 aa  270  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2322  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.82 
 
 
406 aa  270  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2321  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.82 
 
 
406 aa  270  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1024  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.87 
 
 
412 aa  270  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2125  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.87 
 
 
412 aa  270  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2235  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.87 
 
 
444 aa  270  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2366  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.87 
 
 
412 aa  270  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.587886  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1903  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.01 
 
 
406 aa  267  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.06 
 
 
414 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000113167  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0589  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.06 
 
 
414 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3851  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.06 
 
 
414 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3853  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  55.06 
 
 
414 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1960  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.04 
 
 
411 aa  261  6e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.261169  normal  0.0163724 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3127  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.21 
 
 
406 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0407  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.17 
 
 
420 aa  255  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2265  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.17 
 
 
420 aa  255  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.654295  normal  0.518866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3921  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.17 
 
 
420 aa  255  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.174408  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4655  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.17 
 
 
420 aa  255  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119916  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4882  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.17 
 
 
420 aa  255  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.81 
 
 
402 aa  251  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5136  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.21 
 
 
423 aa  235  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.21 
 
 
423 aa  235  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127954  hitchhiker  0.00882366 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5208  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.21 
 
 
423 aa  235  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0957  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.21 
 
 
423 aa  235  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1319  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.21 
 
 
423 aa  235  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.622627  normal  0.467675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0725  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.19 
 
 
411 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6342  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.19 
 
 
408 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6341  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.19 
 
 
408 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2919  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.78 
 
 
408 aa  229  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.77 
 
 
540 aa  227  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0989  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.77 
 
 
540 aa  227  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.77 
 
 
542 aa  227  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1048  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.77 
 
 
540 aa  227  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.13 
 
 
407 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.198877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3328  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.13 
 
 
407 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510687  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2919  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.13 
 
 
407 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000420337  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3050  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.13 
 
 
407 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3147  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.13 
 
 
407 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.166757  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1178  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.13 
 
 
407 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684459  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0130  transposase IS116/IS110/IS902  43.16 
 
 
454 aa  212  5.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3130  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.74 
 
 
378 aa  208  8e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2317  hypothetical protein  71.43 
 
 
310 aa  207  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097002  normal  0.0149356 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2090  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.74 
 
 
378 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000104804  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0087  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.81 
 
 
466 aa  205  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2042  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.81 
 
 
466 aa  205  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.198929  normal  0.0124292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2232  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.81 
 
 
466 aa  205  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000585875  normal  0.443218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1287  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.16 
 
 
465 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.324635  normal  0.577676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0682  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.81 
 
 
466 aa  203  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0858  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.81 
 
 
466 aa  203  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.425839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1282  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.81 
 
 
466 aa  203  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124375  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4398  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.81 
 
 
466 aa  203  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2973  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.81 
 
 
466 aa  203  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0717724  normal  0.0172565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4399  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.81 
 
 
466 aa  203  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0134  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.13 
 
 
435 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1223  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  42.74 
 
 
310 aa  201  7e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12452  transposase  46.09 
 
 
333 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.267636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3494  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.28 
 
 
442 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  0.207887 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1142  ISAfe3, transposase  42.51 
 
 
408 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1265  ISAfe3, transposase  42.51 
 
 
408 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3263  ISAfe3, transposase  42.51 
 
 
408 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2432  ISAfe3, transposase  42.51 
 
 
408 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0550  ISAfe3, transposase  42.51 
 
 
408 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.227474  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1110  ISAfe3, transposase  42.51 
 
 
408 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2972  ISAfe3, transposase  42.51 
 
 
408 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2709  ISAfe3, transposase  42.51 
 
 
408 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0326  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.15 
 
 
408 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1225  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.15 
 
 
408 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1735  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.15 
 
 
408 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.235324 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1944  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.15 
 
 
408 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402524  normal  0.468293 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2147  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.15 
 
 
408 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000616647 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3370  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.15 
 
 
408 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3374  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.15 
 
 
408 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.495996 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3377  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.15 
 
 
408 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.465858 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3378  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.15 
 
 
408 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.195678 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3403  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.15 
 
 
408 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0158163  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3441  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.15 
 
 
408 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.83256 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4041  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.15 
 
 
408 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4042  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.15 
 
 
408 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2958  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.51 
 
 
483 aa  175  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14300  transposase IS116/IS110/IS902  40.56 
 
 
392 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0506  transposase  44.51 
 
 
172 aa  149  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0286  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.07 
 
 
441 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150235  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4136  transposase  29.93 
 
 
446 aa  142  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.888803 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5544  transposase IS116/IS110/IS902  27.9 
 
 
440 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.362719 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0024  transposase  31.85 
 
 
454 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4948  transposase IS111A/IS1328/IS1533  53.04 
 
 
188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1133  ISPpu9, transposase  28.94 
 
 
442 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0282142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1260  ISPpu9, transposase  28.94 
 
 
442 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.469395 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2570  ISPpu9, transposase  28.94 
 
 
442 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110868  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3381  ISPpu9, transposase  28.94 
 
 
442 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3586  ISPpu9, transposase  28.94 
 
 
442 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4603  ISPpu9, transposase  28.94 
 
 
442 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.79364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4791  ISPpu9, transposase  28.94 
 
 
442 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3738  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.37 
 
 
453 aa  119  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>