233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3738 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009955  Dshi_3738  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  100 
 
 
453 aa  931    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0024  transposase  62.5 
 
 
454 aa  554  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.15 
 
 
442 aa  433  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0286  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.62 
 
 
441 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150235  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5544  transposase IS116/IS110/IS902  47.56 
 
 
440 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.362719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4136  transposase  40.37 
 
 
446 aa  340  4e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.888803 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1133  ISPpu9, transposase  41.61 
 
 
442 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0282142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1260  ISPpu9, transposase  41.61 
 
 
442 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.469395 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2570  ISPpu9, transposase  41.61 
 
 
442 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110868  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3381  ISPpu9, transposase  41.61 
 
 
442 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3586  ISPpu9, transposase  41.61 
 
 
442 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4603  ISPpu9, transposase  41.61 
 
 
442 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.79364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4791  ISPpu9, transposase  41.61 
 
 
442 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0095  transposase  47.13 
 
 
333 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.856813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5586  ISPpu9, transposase  33.26 
 
 
451 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1822  ISPpu9, transposase  33.26 
 
 
451 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3247  ISPpu9, transposase  33.26 
 
 
451 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.155481  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1941  ISPpu9, transposase  33.26 
 
 
451 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.662635  normal  0.93243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5999  ISPpu9, transposase  33.26 
 
 
451 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0408226  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3062  ISPpu9, transposase  33.26 
 
 
451 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.231592  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3127  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.49 
 
 
406 aa  220  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1048  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.35 
 
 
540 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.35 
 
 
540 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0989  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.35 
 
 
540 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.35 
 
 
542 aa  218  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6341  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.01 
 
 
408 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6342  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.01 
 
 
408 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0725  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.49 
 
 
411 aa  209  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.34 
 
 
406 aa  207  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2322  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.34 
 
 
406 aa  207  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2321  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.34 
 
 
406 aa  207  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1903  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.34 
 
 
406 aa  206  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.34 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.39 
 
 
414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000113167  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0589  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.39 
 
 
414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3851  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.39 
 
 
414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3853  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.39 
 
 
414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3292  transposase  60.26 
 
 
330 aa  196  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000349541 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3436  transposase IS116/IS110/IS902  33.82 
 
 
412 aa  195  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0087  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.63 
 
 
466 aa  192  7e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2232  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.63 
 
 
466 aa  192  7e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000585875  normal  0.443218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2042  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.63 
 
 
466 aa  192  7e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.198929  normal  0.0124292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4398  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.63 
 
 
466 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0682  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.63 
 
 
466 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0858  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.63 
 
 
466 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.425839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1282  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.63 
 
 
466 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124375  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2973  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.63 
 
 
466 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0717724  normal  0.0172565 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3437  transposase IS116/IS110/IS902  33.57 
 
 
412 aa  192  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222755  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4122  transposase IS116/IS110/IS902  33.57 
 
 
412 aa  192  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4399  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  34.63 
 
 
466 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1287  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.11 
 
 
465 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.324635  normal  0.577676 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1178  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.23 
 
 
407 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684459  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3328  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.23 
 
 
407 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510687  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.23 
 
 
407 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.198877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3050  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.23 
 
 
407 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3147  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.23 
 
 
407 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.166757  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2919  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.23 
 
 
407 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000420337  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1024  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.84 
 
 
412 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2125  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.84 
 
 
412 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2235  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.59 
 
 
444 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2366  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.84 
 
 
412 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.587886  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1959  transposase IS116/IS110/IS902  33.25 
 
 
420 aa  180  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.945198  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2432  ISAfe3, transposase  32.39 
 
 
408 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2709  ISAfe3, transposase  32.39 
 
 
408 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3263  ISAfe3, transposase  32.39 
 
 
408 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1265  ISAfe3, transposase  32.39 
 
 
408 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2124  transposase IS116/IS110/IS902  33.69 
 
 
412 aa  178  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.29674  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2972  ISAfe3, transposase  32.39 
 
 
408 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1142  ISAfe3, transposase  32.39 
 
 
408 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1110  ISAfe3, transposase  32.39 
 
 
408 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0550  ISAfe3, transposase  32.39 
 
 
408 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.227474  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0134  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  32.61 
 
 
435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3130  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.75 
 
 
378 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0407  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.42 
 
 
420 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2265  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.42 
 
 
420 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.654295  normal  0.518866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3921  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.42 
 
 
420 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.174408  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4655  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.42 
 
 
420 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119916  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4882  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.42 
 
 
420 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2919  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  31.04 
 
 
408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2090  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.98 
 
 
378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000104804  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1960  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  30.52 
 
 
411 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.261169  normal  0.0163724 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0130  transposase IS116/IS110/IS902  32.94 
 
 
454 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0957  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.63 
 
 
423 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5136  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.63 
 
 
423 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.63 
 
 
423 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127954  hitchhiker  0.00882366 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0326  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.38 
 
 
408 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1225  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.38 
 
 
408 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1735  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.38 
 
 
408 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.235324 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1944  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.38 
 
 
408 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402524  normal  0.468293 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2147  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.38 
 
 
408 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000616647 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3370  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.38 
 
 
408 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3374  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.38 
 
 
408 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.495996 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3377  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.38 
 
 
408 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.465858 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3378  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.38 
 
 
408 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.195678 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3403  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.38 
 
 
408 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0158163  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3441  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.38 
 
 
408 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.83256 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4041  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.38 
 
 
408 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4042  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.38 
 
 
408 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1319  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.63 
 
 
423 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.622627  normal  0.467675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5208  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  29.63 
 
 
423 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>