20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2678 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2678  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  471  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.733983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3610  hypothetical protein  94.35 
 
 		 230 aa  447  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.141644  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3706  hypothetical protein  89.09 
 
 		 270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.534403  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  38.35 
 
 		 1917 aa  82  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0609  hypothetical protein  50.98 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.313913  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  27.69 
 
 		 1394 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4783  hypothetical protein  46 
 
 		 336 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000597107  normal  0.813715 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  32.03 
 
 		 1365 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4081  YD repeat-containing protein  28.14 
 
 		 713 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  28.74 
 
 		 1411 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  28.74 
 
 		 1411 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3613  hypothetical protein  64.71 
 
 		 254 aa  46.2  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.389609  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0606  YD repeat-containing protein  44.19 
 
 		 3662 aa  45.4  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3207  RHS repeat-containing protein  41.07 
 
 		 2513 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.127821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3729  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  42.31 
 
 		 1753 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  35.78 
 
 		 1411 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  35.78 
 
 		 1411 aa  43.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  35.78 
 
 		 1411 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  35.78 
 
 		 1411 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4789  YD repeat protein  36.54 
 
 		 2864 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>