More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2872 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2872  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  100 
 
 
305 aa  608  1e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4605  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.52 
 
 
315 aa  222  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2678  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.38 
 
 
313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.873608 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1020  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.13 
 
 
315 aa  209  7e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3231  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.73 
 
 
314 aa  207  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7218  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4040  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.58 
 
 
313 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0573  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.78 
 
 
312 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.18897  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0312  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.47 
 
 
297 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347621  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0083  putative electron transfer flavoprotein FixB  37.91 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0085  putative electron transfer flavoprotein FixB  38.24 
 
 
313 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0046  putative electron transfer flavoprotein FixB  37.58 
 
 
313 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0086  putative electron transfer flavoprotein FixB  37.7 
 
 
313 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.424213 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0046  putative electron transfer flavoprotein FixB  37.34 
 
 
313 aa  195  7e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0082  putative electron transfer flavoprotein FixB  37.91 
 
 
313 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0082  putative electron transfer flavoprotein FixB  37.38 
 
 
313 aa  195  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00046  predicted electron transfer flavoprotein, NAD/FAD-binding domain and ETFP adenine nucleotide-binding domain-like protein  37.01 
 
 
313 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3557  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.01 
 
 
313 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00045  hypothetical protein  37.01 
 
 
313 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3613  putative electron transfer flavoprotein FixB  37.01 
 
 
313 aa  194  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0679985 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0044  putative electron transfer flavoprotein FixB  37.01 
 
 
313 aa  193  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.676424  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0048  putative electron transfer flavoprotein FixB  36.69 
 
 
313 aa  192  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1823  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.07 
 
 
293 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.207117  normal  0.343811 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3105  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.8 
 
 
294 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291698 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1396  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  38.51 
 
 
317 aa  187  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0992416  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1944  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.95 
 
 
312 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.436869  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1819  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  37.38 
 
 
311 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3929  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.86 
 
 
319 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.326065 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1483  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  37.38 
 
 
311 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.327265  normal  0.060964 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08780  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.58 
 
 
295 aa  177  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.821197 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1497  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  36.89 
 
 
312 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.186284 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2415  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  35.69 
 
 
312 aa  176  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01667  predicted electron transfer flavoprotein, FAD-binding  35.92 
 
 
312 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01656  hypothetical protein  35.92 
 
 
312 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1991  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  37.05 
 
 
311 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.237399  normal  0.0177014 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1933  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  35.69 
 
 
312 aa  176  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0148505 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1915  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  35.6 
 
 
312 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1465  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  36.39 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.486189 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1901  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  35.6 
 
 
312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1842  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.16 
 
 
296 aa  172  5e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.192292  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1449  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  35.86 
 
 
311 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  0.334512 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0266  hypothetical protein  30.89 
 
 
319 aa  152  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09240  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.15 
 
 
297 aa  149  7e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.263835 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0755  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.13 
 
 
300 aa  144  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.714567 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131964  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0915  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.14 
 
 
296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0314059 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1269  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.33 
 
 
316 aa  139  7.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.877633 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0576  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.93 
 
 
287 aa  137  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.248124  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0439  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.94 
 
 
302 aa  137  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  30.88 
 
 
317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480174  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3332  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.21 
 
 
317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2121  electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.52 
 
 
311 aa  136  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2007  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.88 
 
 
298 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.175857 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3825  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37 
 
 
317 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.194441  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3700  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.93 
 
 
327 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768904  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1078  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  29.25 
 
 
335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.224584 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0332  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  29.45 
 
 
287 aa  126  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.791227  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1544  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  30.29 
 
 
339 aa  126  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1388  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.08 
 
 
317 aa  125  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2262  electron transfer flavoprotein subunit alpha  30.9 
 
 
301 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0143745  hitchhiker  0.000000546266 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1602  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  30.72 
 
 
304 aa  122  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.679429  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1470  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.17 
 
 
302 aa  122  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2783  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.03 
 
 
302 aa  119  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1816  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.23 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378347  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0300  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.33 
 
 
315 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2582  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  30.17 
 
 
335 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2284  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  30.17 
 
 
335 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.383741  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1990  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.33 
 
 
311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1607  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  28.29 
 
 
399 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0583  electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.13 
 
 
341 aa  116  6e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02680  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.12 
 
 
302 aa  115  8.999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.867701 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1103  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.45 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277485  hitchhiker  0.00248079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3759  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  29.15 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0995938  hitchhiker  0.00147037 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0685  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.98 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.999571 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2845  electron transfer flavoprotein subunit alpha  32.88 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.04 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1419  electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.75 
 
 
320 aa  114  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00843459  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0540  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  28.32 
 
 
589 aa  113  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.448343  normal  0.108603 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2199  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.2 
 
 
347 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3301  electron transfer flavoprotein subunit alpha  33.65 
 
 
304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.96 
 
 
326 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1248  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  28.57 
 
 
601 aa  112  9e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.5 
 
 
329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2355  Electron transfer flavoprotein subunit alpha  31.78 
 
 
315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0463  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  44.92 
 
 
332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0386  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.22 
 
 
315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2265  electron transfer flavoprotein subunit alpha  30.43 
 
 
322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0896895  hitchhiker  0.0000142262 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1384  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.55 
 
 
305 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0635  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  28.93 
 
 
610 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3535  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8113  electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.08 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1712  electron transfer flavoprotein subunit alpha  38.16 
 
 
304 aa  109  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.817831 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4277  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  26.28 
 
 
342 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2829  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.15 
 
 
305 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0764  Electron transfer flavoprotein subunit alpha  30.09 
 
 
313 aa  108  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1614  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  29.6 
 
 
308 aa  108  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.455824  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1607  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.88 
 
 
313 aa  108  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2520  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.12 
 
 
304 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09610  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.62 
 
 
317 aa  108  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0631029  normal  0.104642 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3195  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  30.45 
 
 
309 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234178  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5231  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.63 
 
 
314 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0165926  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.2 
 
 
334 aa  107  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00167442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>