More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0266 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0266  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  644    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3929  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  52.19 
 
 
319 aa  345  6e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.326065 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1020  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.36 
 
 
315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4605  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.03 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0312  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.7 
 
 
297 aa  193  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1607  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.46 
 
 
399 aa  192  6e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0540  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.88 
 
 
589 aa  188  9e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.448343  normal  0.108603 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2582  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  34.57 
 
 
335 aa  185  7e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2284  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  34.57 
 
 
335 aa  185  7e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.383741  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1819  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  33.23 
 
 
311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.64 
 
 
410 aa  183  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1465  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  33.23 
 
 
311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.486189 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1396  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  32.12 
 
 
317 aa  182  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0992416  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1449  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  32.92 
 
 
311 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  0.334512 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1991  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  32.92 
 
 
311 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.237399  normal  0.0177014 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3231  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  30.65 
 
 
314 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7218  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1483  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  32.92 
 
 
311 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.327265  normal  0.060964 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1544  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  35.69 
 
 
339 aa  181  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0304  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.07 
 
 
397 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.56 
 
 
329 aa  179  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0309  electron transfer flavoprotein, alpha subunit/FixB family protein  36.76 
 
 
397 aa  178  9e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1933  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  32.1 
 
 
312 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0148505 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0645  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.64 
 
 
345 aa  178  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.229702  hitchhiker  0.000990499 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2007  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.13 
 
 
298 aa  177  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.175857 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2415  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  31.79 
 
 
312 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1497  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  32.1 
 
 
312 aa  176  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.186284 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2372  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.53 
 
 
346 aa  176  4e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1915  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  31.79 
 
 
312 aa  176  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01667  predicted electron transfer flavoprotein, FAD-binding  31.79 
 
 
312 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01656  hypothetical protein  31.79 
 
 
312 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2132  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.13 
 
 
346 aa  176  6e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1944  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32 
 
 
312 aa  176  7e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.436869  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.56 
 
 
329 aa  175  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0476  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.05 
 
 
350 aa  174  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000313809  decreased coverage  0.000297308 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1316  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.93 
 
 
401 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2678  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  30.22 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.873608 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.33 
 
 
299 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131964  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1373  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.33 
 
 
399 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255821  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1901  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  30.96 
 
 
312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1484  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.23 
 
 
397 aa  173  3.9999999999999995e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11518  normal  0.562863 
 
 
-
 
NC_002950  PG1078  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.33 
 
 
335 aa  172  5.999999999999999e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.224584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02680  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.24 
 
 
302 aa  172  5.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.867701 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0755  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.28 
 
 
300 aa  172  7.999999999999999e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.714567 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0131  electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.12 
 
 
333 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4040  electron transfer flavoprotein alpha subunit  29.41 
 
 
313 aa  170  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0573  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.23 
 
 
312 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.18897  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0583  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.02 
 
 
341 aa  169  7e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2199  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.03 
 
 
347 aa  168  9e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0046  putative electron transfer flavoprotein FixB  29.97 
 
 
313 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1194  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.66 
 
 
338 aa  168  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0046  putative electron transfer flavoprotein FixB  29.65 
 
 
313 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1261  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  34.36 
 
 
338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00046  predicted electron transfer flavoprotein, NAD/FAD-binding domain and ETFP adenine nucleotide-binding domain-like protein  29.65 
 
 
313 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3557  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  29.65 
 
 
313 aa  166  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00045  hypothetical protein  29.65 
 
 
313 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2121  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.29 
 
 
311 aa  166  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3613  putative electron transfer flavoprotein FixB  29.65 
 
 
313 aa  166  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0679985 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0044  putative electron transfer flavoprotein FixB  29.56 
 
 
313 aa  166  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.676424  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1554  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.14 
 
 
364 aa  166  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243155  normal  0.702054 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1479  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.44 
 
 
364 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1195  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.44 
 
 
364 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.028424 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0048  putative electron transfer flavoprotein FixB  29.65 
 
 
313 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0083  putative electron transfer flavoprotein FixB  29.32 
 
 
313 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.22 
 
 
326 aa  165  9e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.13 
 
 
325 aa  165  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0059  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  32.52 
 
 
341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122913 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0085  putative electron transfer flavoprotein FixB  29.01 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0368  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.73 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0915  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.14 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0314059 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0086  putative electron transfer flavoprotein FixB  29.01 
 
 
313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.424213 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31 
 
 
443 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2927  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.1 
 
 
452 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0082  putative electron transfer flavoprotein FixB  28.7 
 
 
313 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1358  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.71 
 
 
452 aa  162  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1997  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.97 
 
 
352 aa  162  6e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2786  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.83 
 
 
447 aa  162  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2415  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.72 
 
 
441 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0082  putative electron transfer flavoprotein FixB  29.01 
 
 
313 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2257  electron transfer flavoprotein subunit alpha  32.04 
 
 
442 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00336089  hitchhiker  0.0000000000804212 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0488  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.33 
 
 
370 aa  160  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5085  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.93 
 
 
368 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1467  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.44 
 
 
447 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2796  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.04 
 
 
340 aa  159  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1089  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.14 
 
 
368 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.419334  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.21 
 
 
317 aa  159  6e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2266  electron transfer flavoprotein  33.33 
 
 
365 aa  158  9e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2775  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.03 
 
 
428 aa  159  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3597  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.43 
 
 
342 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  31.21 
 
 
443 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0831  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.33 
 
 
325 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0635  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.32 
 
 
610 aa  157  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3535  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1539  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.84 
 
 
439 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2066  electron transfer flavoprotein subunit alpha  30.28 
 
 
448 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0985  electron transfer flavoprotein subunit beta  33.84 
 
 
367 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1435  electron transfer flavoprotein fixB (alpha subunit)  31.03 
 
 
367 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000130268  normal  0.0153048 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  34.42 
 
 
317 aa  157  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480174  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3686  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.03 
 
 
348 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1248  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  29.6 
 
 
601 aa  156  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4014  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.51 
 
 
663 aa  155  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.797538  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0332  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.01 
 
 
287 aa  155  7e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.791227  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>