More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0573 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0573  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  100 
 
 
312 aa  628  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.18897  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4605  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  52.26 
 
 
315 aa  340  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1020  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.55 
 
 
315 aa  340  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4040  electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.34 
 
 
313 aa  280  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3231  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  44.19 
 
 
314 aa  278  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7218  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1497  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  45.45 
 
 
312 aa  272  6e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.186284 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1944  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.45 
 
 
312 aa  272  7e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.436869  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2415  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  45.45 
 
 
312 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01667  predicted electron transfer flavoprotein, FAD-binding  45.45 
 
 
312 aa  271  9e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01656  hypothetical protein  45.45 
 
 
312 aa  271  9e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2678  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  44.19 
 
 
313 aa  270  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.873608 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1933  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  45.45 
 
 
312 aa  270  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0148505 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1915  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  45.13 
 
 
312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1901  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  44.48 
 
 
312 aa  265  8e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0046  putative electron transfer flavoprotein FixB  43 
 
 
313 aa  263  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1396  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  43.09 
 
 
317 aa  263  4e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0992416  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0046  putative electron transfer flavoprotein FixB  42.81 
 
 
313 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0312  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.48 
 
 
297 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347621  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0044  putative electron transfer flavoprotein FixB  42.81 
 
 
313 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.676424  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00046  predicted electron transfer flavoprotein, NAD/FAD-binding domain and ETFP adenine nucleotide-binding domain-like protein  42.81 
 
 
313 aa  261  8e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3557  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.81 
 
 
313 aa  261  8e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3613  putative electron transfer flavoprotein FixB  42.81 
 
 
313 aa  261  8e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0679985 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00045  hypothetical protein  42.81 
 
 
313 aa  261  8e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0083  putative electron transfer flavoprotein FixB  42.62 
 
 
313 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0048  putative electron transfer flavoprotein FixB  42.48 
 
 
313 aa  259  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0085  putative electron transfer flavoprotein FixB  42.62 
 
 
313 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0082  putative electron transfer flavoprotein FixB  42.3 
 
 
313 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0086  putative electron transfer flavoprotein FixB  42.62 
 
 
313 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.424213 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0082  putative electron transfer flavoprotein FixB  42.62 
 
 
313 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1449  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  42.48 
 
 
311 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  0.334512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1819  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  42.72 
 
 
311 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1465  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  42.72 
 
 
311 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.486189 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1483  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  42.72 
 
 
311 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.327265  normal  0.060964 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1991  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  42.39 
 
 
311 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.237399  normal  0.0177014 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2872  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.78 
 
 
305 aa  232  5e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1823  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.2 
 
 
293 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.207117  normal  0.343811 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08780  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.33 
 
 
295 aa  199  5e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.821197 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3929  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.01 
 
 
319 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.326065 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0266  hypothetical protein  33.86 
 
 
319 aa  189  5e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3105  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.4 
 
 
294 aa  185  9e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291698 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1842  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.95 
 
 
296 aa  182  7e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.192292  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0755  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.15 
 
 
300 aa  166  4e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.714567 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02680  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.54 
 
 
302 aa  160  3e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.867701 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.09 
 
 
410 aa  159  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0635  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.01 
 
 
610 aa  157  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3535  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3615  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.01 
 
 
368 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0544664 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.69 
 
 
299 aa  155  1e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131964  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2007  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.11 
 
 
298 aa  154  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.175857 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0915  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.47 
 
 
296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0314059 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0540  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.45 
 
 
589 aa  151  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.448343  normal  0.108603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5085  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.69 
 
 
368 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10530  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, FixB  31.33 
 
 
360 aa  146  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291846  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1078  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.69 
 
 
335 aa  146  5e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.224584 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1544  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  31.29 
 
 
339 aa  145  6e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1089  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.69 
 
 
368 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.419334  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2582  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  31.44 
 
 
335 aa  145  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2284  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  31.44 
 
 
335 aa  145  9e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.383741  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4258  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.86 
 
 
318 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0141  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.01 
 
 
369 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0059  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  30.87 
 
 
341 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122913 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4447  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.69 
 
 
369 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5871  protein FixB  33.44 
 
 
368 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.61 
 
 
329 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13044  electron transfer flavoprotein alpha subunit fixB  35.64 
 
 
318 aa  144  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00188433  hitchhiker  0.00116016 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1607  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.41 
 
 
399 aa  143  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0309  electron transfer flavoprotein, alpha subunit/FixB family protein  32.13 
 
 
397 aa  143  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1248  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.39 
 
 
601 aa  143  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0304  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.8 
 
 
397 aa  143  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  33.11 
 
 
317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.08 
 
 
439 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1316  electron transfer flavoprotein alpha subunit  29.77 
 
 
401 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0985  electron transfer flavoprotein subunit alpha  30.77 
 
 
312 aa  139  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0954  electron transfer flavoprotein subunit alpha  30.77 
 
 
312 aa  139  6e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.8 
 
 
326 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.76 
 
 
329 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2199  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.35 
 
 
347 aa  139  8.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.74 
 
 
442 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4418  electron transfer flavoprotein subunit alpha  31.25 
 
 
325 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4257  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.25 
 
 
325 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0439  electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.76 
 
 
302 aa  137  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4759  electron transfer flavoprotein subunit alpha  31.25 
 
 
325 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2266  electron transfer flavoprotein  31.56 
 
 
365 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4634  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.25 
 
 
325 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2121  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.63 
 
 
311 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0583  electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.39 
 
 
341 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1554  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.36 
 
 
364 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243155  normal  0.702054 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3759  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.67 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0995938  hitchhiker  0.00147037 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4350  electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.25 
 
 
325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.233822  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09240  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.83 
 
 
297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.263835 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0985  electron transfer flavoprotein subunit beta  31.41 
 
 
367 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0257  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.6 
 
 
314 aa  136  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.589105  normal  0.147331 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.94 
 
 
325 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3259  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.46 
 
 
317 aa  136  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3576  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.05 
 
 
369 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.846794  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0332  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.62 
 
 
287 aa  135  8e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.791227  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4649  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  30.92 
 
 
325 aa  135  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4650  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  30.92 
 
 
325 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4269  electron transfer flavoprotein, alpha subunit (alpha-ETF)  30.92 
 
 
325 aa  135  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4630  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  30.92 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0583219  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2100  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.31 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>