33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2604 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2604  single-strand binding protein  100 
 
 		 168 aa  343  8.999999999999999e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.137931  decreased coverage  0.0000000924052 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  25.99 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0148  single-stranded DNA-binding protein  31.31 
 
 		 125 aa  47.8  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0104  single-stranded DNA-binding protein  31.63 
 
 		 125 aa  47.4  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  29.67 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  29.52 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  29.59 
 
 		 200 aa  47  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  28.99 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0301  single-stranded DNA-binding protein  27.27 
 
 		 120 aa  45.4  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  28.57 
 
 		 159 aa  44.7  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 168 aa  44.3  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  30.46 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  24.14 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  24.14 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  23.16 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  29.67 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  22.54 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  24.14 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  26.17 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  30.43 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  30.77 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17491  single-stranded DNA-binding protein  32.22 
 
 		 127 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.932532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  28.47 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  26.81 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  29.67 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  29.67 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  25.21 
 
 		 188 aa  41.2  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18151  single-stranded DNA-binding protein  31.11 
 
 		 124 aa  41.2  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  26.19 
 
 		 150 aa  40.8  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1716  single-stranded DNA-binding protein  31.11 
 
 		 133 aa  41.2  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1149  single-stranded DNA-binding protein  29.13 
 
 		 119 aa  40.8  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499901 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  25.71 
 
 		 168 aa  40.8  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>