More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1257 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1257  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  100 
 
 
351 aa  714    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.574418  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06070  rod shape-determining protein MreB  88.6 
 
 
349 aa  607  9.999999999999999e-173  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000340922 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14240  rod shape-determining protein MreB  89.02 
 
 
355 aa  594  1e-169  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.799337  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0670  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  60.6 
 
 
347 aa  410  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  54.12 
 
 
343 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  53.85 
 
 
343 aa  349  4e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  53.82 
 
 
340 aa  341  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  51.73 
 
 
346 aa  340  2e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  52.06 
 
 
343 aa  339  2.9999999999999998e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  52.49 
 
 
344 aa  339  5e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  52.84 
 
 
340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  51.44 
 
 
350 aa  335  7e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  50.71 
 
 
347 aa  335  7e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  51.76 
 
 
343 aa  334  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  50.14 
 
 
347 aa  332  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0187  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  48.69 
 
 
344 aa  332  8e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00128251  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  51.34 
 
 
340 aa  331  1e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  49.86 
 
 
347 aa  330  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  51.8 
 
 
339 aa  329  4e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  52.19 
 
 
344 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  51.9 
 
 
344 aa  328  6e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  52.84 
 
 
344 aa  328  7e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  51.04 
 
 
342 aa  328  7e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  52.19 
 
 
344 aa  328  8e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  52.19 
 
 
344 aa  328  8e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  52.84 
 
 
344 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  52.84 
 
 
344 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  50.6 
 
 
345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  52.84 
 
 
342 aa  325  5e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 
346 aa  325  9e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 
346 aa  324  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  50.44 
 
 
346 aa  324  1e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  52.73 
 
 
340 aa  324  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  51.18 
 
 
343 aa  323  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1529  rod shape-determining protein MreB  50.72 
 
 
342 aa  323  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0844761  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  49.29 
 
 
347 aa  323  3e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  49 
 
 
347 aa  323  4e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  50.87 
 
 
346 aa  322  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  49 
 
 
347 aa  323  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  49.43 
 
 
347 aa  322  8e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  50.88 
 
 
342 aa  322  8e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  51.34 
 
 
343 aa  322  9.000000000000001e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  52.63 
 
 
344 aa  321  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  51.64 
 
 
343 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  51.82 
 
 
339 aa  320  3e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0109  rod shape-determining protein Mbl  48.65 
 
 
343 aa  320  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  52.15 
 
 
342 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2017  rod shape-determining protein MreB  50.15 
 
 
346 aa  320  3e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.881411  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0868  rod shape-determining protein MreB  47.69 
 
 
345 aa  319  3.9999999999999996e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  50.15 
 
 
346 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  52.15 
 
 
342 aa  319  5e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  50.45 
 
 
343 aa  319  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1694  rod shape-determining protein MreB  48.24 
 
 
346 aa  318  6e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  49.57 
 
 
345 aa  318  7e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  50.29 
 
 
348 aa  318  7e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  50.58 
 
 
343 aa  318  7.999999999999999e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  52.54 
 
 
344 aa  318  9e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0325  rod shape-determining protein MreB  47.94 
 
 
346 aa  318  1e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.208455  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1465  rod shape-determining protein MreB  48.1 
 
 
345 aa  318  1e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28948  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  47.55 
 
 
344 aa  318  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0303  rod shape-determining protein MreB  47.94 
 
 
346 aa  318  1e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2125  rod shape-determining protein MreB  47.11 
 
 
345 aa  317  2e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.55936  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0317  rod shape-determining protein MreB  47.81 
 
 
345 aa  316  3e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.594365  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0330  rod shape-determining protein MreB  50.9 
 
 
336 aa  316  4e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000934452  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0348  rod shape-determining protein MreB  50.9 
 
 
336 aa  316  4e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0865019  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2468  MreB/Mrl family cell shape determining protein  50.3 
 
 
343 aa  316  4e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.560216 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  48.39 
 
 
348 aa  316  4e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  49.85 
 
 
344 aa  315  6e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2749  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  48.62 
 
 
339 aa  315  6e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 
346 aa  315  6e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  48.65 
 
 
344 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1352  rod shape-determining protein MreB  46.36 
 
 
343 aa  314  9.999999999999999e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.261173  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  51.16 
 
 
346 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  49.25 
 
 
344 aa  314  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1397  rod shape-determining protein MreB  47.79 
 
 
345 aa  314  9.999999999999999e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  48.36 
 
 
344 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  49.13 
 
 
347 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  48.48 
 
 
345 aa  314  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  49.71 
 
 
349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  49.7 
 
 
368 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 
338 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  50.29 
 
 
346 aa  311  7.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1489  rod shape-determining protein MreB  49.42 
 
 
347 aa  311  9e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2374  rod shape-determining protein Mbl  46.43 
 
 
342 aa  311  1e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0449993  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  49.55 
 
 
347 aa  311  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1993  rod shape-determining protein MreB  49.55 
 
 
340 aa  310  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.874884  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0320  rod shape-determining protein MreB  50 
 
 
352 aa  310  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  48.5 
 
 
339 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0445  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  48.52 
 
 
337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0596021 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  48.5 
 
 
339 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  48.5 
 
 
339 aa  309  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  48.5 
 
 
339 aa  309  4e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  48.5 
 
 
339 aa  309  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  48.5 
 
 
339 aa  309  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  48.5 
 
 
339 aa  309  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  48.5 
 
 
339 aa  309  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  48.5 
 
 
339 aa  309  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2835  rod shape-determining protein Mbl  48.62 
 
 
345 aa  309  5e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  48.5 
 
 
339 aa  309  5e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  46.99 
 
 
348 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>