More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1959 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2449  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  85.2 
 
 		 499 aa  892    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0900225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1959  FeS assembly protein SufB  100 
 
 		 495 aa  1039    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1972  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  95.96 
 
 		 495 aa  1000    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000399333 
 
 
-
 
NC_002950  PG0257  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  62.32 
 
 		 481 aa  642    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1184  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  62.93 
 
 		 482 aa  647    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3284  FeS assembly protein SufB  61.88 
 
 		 479 aa  640    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0992  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  67.08 
 
 		 481 aa  678    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2918  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  62.14 
 
 		 490 aa  636    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.581935 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1448  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  64.72 
 
 		 484 aa  658    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0931  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  60.52 
 
 		 507 aa  640    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122156  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2593  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  84.13 
 
 		 503 aa  888    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1742  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  84.33 
 
 		 503 aa  889    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451292  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3262  FeS assembly protein SufB  61.54 
 
 		 482 aa  639    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1948  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  100 
 
 		 495 aa  1039    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000269575 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0729  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.12 
 
 		 485 aa  639    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0652  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.67 
 
 		 482 aa  654    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0636  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.88 
 
 		 482 aa  654    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1502  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  95.96 
 
 		 495 aa  999    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.981811  hitchhiker  0.00000181551 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0332  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  62.78 
 
 		 490 aa  635    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0424  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  64.62 
 
 		 479 aa  661    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.746607  normal  0.0638657 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1899  FeS assembly protein SufB  62.5 
 
 		 502 aa  640    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2490  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  64.51 
 
 		 482 aa  659    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0796  FeS assembly protein SufB  64.62 
 
 		 479 aa  661    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300367  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5848  FeS assembly protein SufB  62.35 
 
 		 489 aa  639    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.843963  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0579  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  73.14 
 
 		 496 aa  743    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00207059  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  64.72 
 
 		 480 aa  658    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3040  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.47 
 
 		 481 aa  656    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.128199 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1608  FeS assembly protein SufB  61.03 
 
 		 490 aa  637    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0033027 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1735  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  64.3 
 
 		 479 aa  656    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0696  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.47 
 
 		 478 aa  650    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.408407  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2573  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.75 
 
 		 484 aa  659    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0843  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  64.67 
 
 		 479 aa  656    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177229  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1170  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.33 
 
 		 481 aa  644    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.444393 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0426  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.6 
 
 		 480 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2022  FeS assembly protein SufB  62.68 
 
 		 486 aa  635    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126519  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1860  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.05 
 
 		 478 aa  640    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1414  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.12 
 
 		 479 aa  645    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.80589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4269  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.2 
 
 		 482 aa  652    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0903  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  64.58 
 
 		 479 aa  652    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.698601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04440  hypothetical protein  64.51 
 
 		 481 aa  650    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30977  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0465  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  76.63 
 
 		 491 aa  775    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.259623  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0925  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  60.76 
 
 		 507 aa  637    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1899  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  99.8 
 
 		 495 aa  1038    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0214844  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2751  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  84.2 
 
 		 499 aa  884    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199856  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0098  FeS assembly protein SufB  58.54 
 
 		 506 aa  646    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.782387 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0818  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  62.92 
 
 		 485 aa  637    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1467  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  96.16 
 
 		 495 aa  1002    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.149151  normal  0.114859 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1781  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  60.2 
 
 		 503 aa  637    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0978  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  64.66 
 
 		 481 aa  661    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.231871 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4355  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  62.84 
 
 		 478 aa  643    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.365891  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0725  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.88 
 
 		 482 aa  659    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2575  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.47 
 
 		 481 aa  644    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4469  FeS assembly protein SufB  61.89 
 
 		 490 aa  648    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.424246 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1761  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  93.94 
 
 		 495 aa  984    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337017 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1764  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  100 
 
 		 495 aa  1039    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.135564  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01357  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  62.71 
 
 		 478 aa  643    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.456258  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2255  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  60.71 
 
 		 507 aa  641    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1344  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  62.84 
 
 		 478 aa  641    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.430599  hitchhiker  0.000000189846 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2180  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  84.17 
 
 		 498 aa  879    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261819  hitchhiker  0.000852702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1468  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  61.86 
 
 		 489 aa  638    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.454398  normal  0.0337836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1513  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  99.6 
 
 		 495 aa  1037    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205188 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1508  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  62.42 
 
 		 483 aa  646    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0755494 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1483  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  95.96 
 
 		 495 aa  998    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000585314 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3151  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  64.93 
 
 		 482 aa  655    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.347043  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3450  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.6 
 
 		 479 aa  652    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00551493  hitchhiker  0.00000000835883 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0889  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  64.88 
 
 		 479 aa  658    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.741198  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0539  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  61.71 
 
 		 491 aa  649    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3309  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  60.76 
 
 		 496 aa  640    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.218946  normal  0.0498365 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0415  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.6 
 
 		 480 aa  653    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1695  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  83.4 
 
 		 499 aa  888    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.753798  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0893  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  64.67 
 
 		 479 aa  657    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1801  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  96.16 
 
 		 495 aa  1002    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0601215  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3608  FeS assembly protein SufB  62.17 
 
 		 497 aa  645    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.93243 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2094  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  59.15 
 
 		 509 aa  635    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0260072  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2272  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  62.12 
 
 		 483 aa  654    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1848  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  84.33 
 
 		 503 aa  889    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.387887  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4729  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  63.14 
 
 		 480 aa  656    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2397  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  99.8 
 
 		 495 aa  1037    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.357216  hitchhiker  0.000650358 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1001  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  61.7 
 
 		 491 aa  631  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.260746 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2362  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  58.94 
 
 		 509 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4345  FeS assembly protein SufB  61.32 
 
 		 489 aa  632  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2841  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  61.35 
 
 		 493 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1192  FeS assembly protein SufB  60.91 
 
 		 499 aa  632  1e-180  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0017395  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3977  FeS assembly protein SufB  61.11 
 
 		 489 aa  629  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.229851  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1664  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  60.12 
 
 		 493 aa  629  1e-179  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16322  ABC(membrane) family transporter (Fe-S assembly/SufBCD system)  61.38 
 
 		 471 aa  628  1e-179  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1233  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  62 
 
 		 480 aa  630  1e-179  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.737377  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3966  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  59.51 
 
 		 498 aa  630  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2435  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  60.41 
 
 		 489 aa  630  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3964  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  59.23 
 
 		 508 aa  628  1e-179  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00244471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4457  FeS assembly protein SufB  60.7 
 
 		 489 aa  625  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985425  normal  0.145425 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2588  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  59.1 
 
 		 489 aa  627  1e-178  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.386299  normal  0.392134 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0694  FeS assembly protein SufB  61.11 
 
 		 489 aa  627  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.415749  normal  0.0650499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5109  FeS assembly protein SufB  60.7 
 
 		 489 aa  625  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136802 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2107  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  60.82 
 
 		 489 aa  627  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.862611  normal  0.0704835 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2994  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  59.04 
 
 		 498 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0632378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2456  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  59.63 
 
 		 493 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1242  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  59.15 
 
 		 506 aa  627  1e-178  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1900  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  60.82 
 
 		 489 aa  626  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000572283 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01979  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  61.25 
 
 		 485 aa  627  1e-178  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>