More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2315 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2315  Chorismate binding-like protein  100 
 
 
547 aa  1086    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3618  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  47.83 
 
 
422 aa  325  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.987747  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2621  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  57.75 
 
 
523 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260936  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3907  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.45 
 
 
472 aa  181  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.177197  normal  0.165975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4276  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.45 
 
 
466 aa  179  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1564  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.81 
 
 
469 aa  179  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4379  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.73 
 
 
472 aa  178  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743328  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  43.68 
 
 
471 aa  179  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.88 
 
 
741 aa  178  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3614  para-aminobenzoate synthase component I  33.85 
 
 
497 aa  176  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40.56 
 
 
460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1638  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.61 
 
 
457 aa  173  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3709  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.84 
 
 
488 aa  171  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0131027  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2221  para-aminobenzoate synthase component I  40.29 
 
 
467 aa  169  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1943  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.69 
 
 
470 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000110873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  37.33 
 
 
408 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2208  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.77 
 
 
461 aa  168  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0392675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1950  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.03 
 
 
470 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00695356  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1627  para-aminobenzoate synthase, subunit I  32.66 
 
 
458 aa  166  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.18817  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1917  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.42 
 
 
470 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000833376  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.52 
 
 
460 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0053  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.24 
 
 
464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  35.06 
 
 
495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2125  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40.29 
 
 
467 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0898059  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  37.33 
 
 
453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1687  para-aminobenzoate synthase, component I  38.83 
 
 
471 aa  164  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  0.427027 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2376  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.29 
 
 
470 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000419879  normal  0.281774 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.97 
 
 
466 aa  163  6e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00203234  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  41.3 
 
 
468 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1913  para-aminobenzoate synthase, component I  37.22 
 
 
509 aa  162  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.199301  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2201  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.56 
 
 
467 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000754609  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2398  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.07 
 
 
457 aa  161  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2303  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40.15 
 
 
467 aa  161  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1770  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.04 
 
 
447 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000783335 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23160  para-aminobenzoate synthase, component I  36.41 
 
 
443 aa  160  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1964  aminodeoxychorismate synthase, component I  38.52 
 
 
454 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1334  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  34.48 
 
 
465 aa  159  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1492  aminodeoxychorismate synthase subunit I  38.52 
 
 
454 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2381  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  38.99 
 
 
455 aa  158  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1766  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.26 
 
 
718 aa  159  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.556593 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2157  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.72 
 
 
473 aa  159  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169831  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3582  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.22 
 
 
474 aa  158  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00051468  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.1 
 
 
480 aa  158  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01948  P-aminobenzoate synthetase, component I  37.79 
 
 
476 aa  157  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0024318  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.74 
 
 
466 aa  157  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1580  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.85 
 
 
449 aa  157  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00938463  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1666  aminodeoxychorismate synthase, glutamine amidotransferase subunit / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  40.89 
 
 
700 aa  156  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1968  aminodeoxychorismate synthase, component I  38.16 
 
 
454 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2025  aminodeoxychorismate synthase, component I  38.16 
 
 
454 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.425032  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1307  aminodeoxychorismate synthase, component I  38.16 
 
 
454 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.312058  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01782  para-aminobenzoate synthase component I  37.63 
 
 
453 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2226  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.42 
 
 
467 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  hitchhiker  0.0081347 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01770  hypothetical protein  37.63 
 
 
445 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.994837  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1376  aminodeoxychorismate synthase  37.63 
 
 
453 aa  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.661176  normal  0.079748 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2040  para-aminobenzoate synthase component I  37.63 
 
 
453 aa  155  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2424  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  37.69 
 
 
448 aa  155  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.95872  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3444  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.87 
 
 
435 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.716101  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2037  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.5 
 
 
490 aa  155  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00107274  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2073  aminodeoxychorismate synthase  37.63 
 
 
453 aa  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1831  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.63 
 
 
453 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306293  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2282  para-aminobenzoate synthase, component I  34.23 
 
 
447 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1821  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.63 
 
 
453 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2897  para-aminobenzoate synthase, component I  40.66 
 
 
686 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0159595  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.88 
 
 
447 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389074  hitchhiker  0.0000000000236319 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1902  para-aminobenzoate synthase component I  37.63 
 
 
453 aa  154  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1759  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  33.97 
 
 
447 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  34.59 
 
 
466 aa  154  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3441  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.87 
 
 
446 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165504  normal  0.0282408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2329  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.87 
 
 
446 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000053464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2541  aminodeoxychorismate synthase  37.63 
 
 
453 aa  154  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.169515  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2017  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.21 
 
 
452 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.75 
 
 
509 aa  153  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1346  para-aminobenzoate synthase component I  37.45 
 
 
456 aa  153  8.999999999999999e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1987  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.83 
 
 
456 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2353  para-aminobenzoate synthase, component I  37.18 
 
 
458 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3888  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.65 
 
 
480 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.353677  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.69 
 
 
469 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1636  para-aminobenzoate synthase component I  37.18 
 
 
458 aa  152  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.65 
 
 
482 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151682  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0875  hypothetical protein  39.33 
 
 
454 aa  152  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1671  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  35.19 
 
 
444 aa  152  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3994  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.51 
 
 
493 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.906481  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  37.23 
 
 
430 aa  151  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2449  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.82 
 
 
458 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  37.23 
 
 
430 aa  151  4e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2323  anthranilate synthase, component I  33.87 
 
 
518 aa  150  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.933209  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3258  anthranilate synthase component I-like protein  35.25 
 
 
511 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3761  para-aminobenzoate synthase  39.41 
 
 
703 aa  150  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0331515  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.51 
 
 
592 aa  150  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2866  anthranilate synthase component I-like protein  35.74 
 
 
469 aa  150  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2967  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.82 
 
 
474 aa  149  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0339276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2540  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  35.68 
 
 
466 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196629  hitchhiker  0.000544735 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2111  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.41 
 
 
687 aa  148  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0378177  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  34.64 
 
 
462 aa  148  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.64 
 
 
480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3722  anthranilate synthase component I  34.9 
 
 
491 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.803971 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0064  anthranilate synthase  35.06 
 
 
465 aa  147  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1930  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.89 
 
 
480 aa  146  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5240  para-aminobenzoate synthase, component I  35.06 
 
 
465 aa  146  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1132  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  41.03 
 
 
474 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>