65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0786 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0786  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  100 
 
 
515 aa  1027    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0684  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  56.16 
 
 
551 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0872  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  58.97 
 
 
515 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.559562  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2939  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  55.87 
 
 
540 aa  565  1e-160  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  normal  0.269188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3233  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  54.78 
 
 
538 aa  560  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.384079  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3721  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  54.41 
 
 
538 aa  554  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059695 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1230  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  51.58 
 
 
602 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.479745  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1201  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  51.58 
 
 
602 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4555  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  50.61 
 
 
605 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0777  R3H domain-containing protein  52.56 
 
 
509 aa  508  1e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.191929  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_683  R3H domain protein  52.66 
 
 
537 aa  510  1e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0126  single-stranded nucleic acid binding R3H  49.31 
 
 
579 aa  511  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0703  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  52.35 
 
 
509 aa  499  1e-140  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0625  single-stranded nucleic acid binding R3H  49.03 
 
 
588 aa  496  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.57022  normal  0.210072 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2072  single-stranded nucleic acid-binding R3H domain-containing protein  47.66 
 
 
579 aa  482  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0600  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  49.82 
 
 
584 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767642  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0379  ATPase  49.25 
 
 
546 aa  468  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.788965  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2975  single-stranded nucleic acid binding R3H  51.69 
 
 
496 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38424  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0032  AAA ATPase  54.34 
 
 
445 aa  464  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22991  AAA ATPase superfamily protein  48.54 
 
 
545 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1951  ATPase  47.98 
 
 
539 aa  444  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3015  single-stranded nucleic acid binding R3H  64.72 
 
 
590 aa  421  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0100908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0499  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  63 
 
 
565 aa  420  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000861102  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4406  predicted protein  61.11 
 
 
335 aa  396  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.746499 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_1953  predicted protein  42.31 
 
 
552 aa  395  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0528  AAA ATPase  39.73 
 
 
318 aa  214  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.162948 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0513  AAA ATPase  40.07 
 
 
322 aa  214  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.203614 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3621  AAA ATPase  36.65 
 
 
386 aa  193  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2960  AAA ATPase  34.1 
 
 
322 aa  164  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0931  stage III sporulation protein AA  26.74 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.719213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4303  stage III sporulation protein AA  26.74 
 
 
308 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1801  stage III sporulation protein AA  25.45 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2087  stage III sporulation protein AA  25.45 
 
 
294 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.963065  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2887  sporulation stage III protein AA  25 
 
 
307 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4323  stage III sporulation protein AA  26.37 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4266  stage III sporulation protein AA  26.01 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3946  stage III sporulation protein AA  26.01 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1713  stage III sporulation protein AA  34.43 
 
 
322 aa  72.8  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4097  stage III sporulation protein AA  25.64 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3935  stage III sporulation protein AA  25.64 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4417  stage III sporulation protein AA  25.64 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4213  stage III sporulation protein AA  25.64 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0252456 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1525  AAA ATPase  30.3 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0235  stage III sporulation protein AA  31.58 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06170  Sporulation stage III protein AA  35.82 
 
 
316 aa  69.7  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4046  sporulation stage III protein AA  25.32 
 
 
308 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1916  stage III sporulation protein AA  27 
 
 
331 aa  63.9  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0845  stage III sporulation protein spoIIIAA  30.72 
 
 
336 aa  63.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000346466  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2336  stage III sporulation protein AA  26.35 
 
 
308 aa  62  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1056  hypothetical protein  29.88 
 
 
337 aa  58.2  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0117191  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0990  AAA ATPase  26.55 
 
 
313 aa  56.6  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1007  AAA ATPase  29.56 
 
 
332 aa  55.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1536  hypothetical protein  29 
 
 
350 aa  56.2  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.127679 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3516  stage III sporulation protein AA  28.12 
 
 
361 aa  55.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00709627  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2611  stage III sporulation protein AA  30 
 
 
345 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0550  stage III sporulation protein spoIIIAA  28.08 
 
 
313 aa  50.1  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.852342  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2524  stage III sporulation protein AA  26.71 
 
 
322 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1793  stage III sporulation protein AA  25.68 
 
 
334 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1329  type II secretion system protein E  27.38 
 
 
342 aa  49.3  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.336325  normal  0.041455 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2157  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  40 
 
 
199 aa  47.4  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1054  type II secretion system protein E  29.23 
 
 
342 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.143641 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0909  putative NTPase  29.91 
 
 
174 aa  44.7  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1686  stage III sporulation protein AA  29.38 
 
 
323 aa  44.3  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4000  DNA repair protein RadA  31.67 
 
 
452 aa  44.3  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405173  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1440  hypothetical protein  37.74 
 
 
177 aa  43.5  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>