35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0909 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0909  putative NTPase  100 
 
 
174 aa  340  7e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0887  putative NTPase  88.37 
 
 
179 aa  298  3e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120565  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0940  putative NTPase  48.72 
 
 
181 aa  144  9e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0296  protein of unknown function DUF265  40.56 
 
 
179 aa  130  9e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1005  putative NTPase  42.77 
 
 
182 aa  124  6e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3054  putative NTPase  40.24 
 
 
174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507347  normal  0.799807 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0640  protein of unknown function DUF265  42.59 
 
 
177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309615  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1583  protein of unknown function DUF265  39.64 
 
 
169 aa  105  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2900  protein of unknown function DUF265  36.21 
 
 
175 aa  97.8  6e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0312  hypothetical protein  35.29 
 
 
173 aa  89  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0721  hypothetical protein  37.64 
 
 
180 aa  89  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.763647  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1760  putative NTPase  36.84 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000221157 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1742  AAA ATPase  29.48 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1537  putative NTPase  34.94 
 
 
175 aa  77.4  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0548  putative NTPase  37.96 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.955117  normal  0.0174425 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1717  putative NTPase  32.94 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0465862 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19950  nucleotide kinase  26.82 
 
 
180 aa  64.3  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0269  molybdenum cofactor guanylyltransferase  25 
 
 
381 aa  53.1  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2012  ATPase  23.6 
 
 
188 aa  50.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.378806  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0729  nucleotide kinase-like protein  25.28 
 
 
194 aa  48.9  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_109  MobA protein  23.08 
 
 
378 aa  48.1  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0684  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  31.62 
 
 
551 aa  48.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0786  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  29.91 
 
 
515 aa  44.7  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22991  AAA ATPase superfamily protein  29.06 
 
 
545 aa  44.3  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0159  nucleotide kinase  28.35 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0034  nucleotide kinase-like protein  29.87 
 
 
229 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1951  ATPase  28.21 
 
 
539 aa  42.4  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4406  predicted protein  27.12 
 
 
335 aa  42  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.746499 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0032  AAA ATPase  31.07 
 
 
445 aa  42  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0777  R3H domain-containing protein  29.06 
 
 
509 aa  41.6  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.191929  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0703  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  28.81 
 
 
509 aa  41.6  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_683  R3H domain protein  29.06 
 
 
537 aa  41.6  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  28.07 
 
 
444 aa  41.2  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0379  ATPase  28.21 
 
 
546 aa  41.2  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.788965  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0600  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  29.06 
 
 
584 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767642  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>