62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2939 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0499  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  61.4 
 
 
565 aa  664    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000861102  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3721  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  70.35 
 
 
538 aa  733    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059695 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3233  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  69.96 
 
 
538 aa  734    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.384079  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2939  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  100 
 
 
540 aa  1083    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  normal  0.269188 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0684  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  57.27 
 
 
551 aa  596  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0786  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  55.47 
 
 
515 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0872  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  56.21 
 
 
515 aa  539  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.559562  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0777  R3H domain-containing protein  53.45 
 
 
509 aa  537  1e-151  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.191929  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_683  R3H domain protein  53.52 
 
 
537 aa  538  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0703  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  53.36 
 
 
509 aa  535  1e-151  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0625  single-stranded nucleic acid binding R3H  50.44 
 
 
588 aa  525  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.57022  normal  0.210072 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4555  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  51.47 
 
 
605 aa  521  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1201  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  49.65 
 
 
602 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1230  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  49.65 
 
 
602 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.479745  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3015  single-stranded nucleic acid binding R3H  48.4 
 
 
590 aa  513  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0100908 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0126  single-stranded nucleic acid binding R3H  49.65 
 
 
579 aa  506  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2072  single-stranded nucleic acid-binding R3H domain-containing protein  48.12 
 
 
579 aa  491  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0600  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  48.91 
 
 
584 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767642  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1951  ATPase  50.09 
 
 
539 aa  482  1e-135  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0032  AAA ATPase  51.62 
 
 
445 aa  473  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0379  ATPase  49.72 
 
 
546 aa  471  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.788965  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22991  AAA ATPase superfamily protein  49.43 
 
 
545 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2975  single-stranded nucleic acid binding R3H  49.34 
 
 
496 aa  450  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38424  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_1953  predicted protein  44.22 
 
 
552 aa  418  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4406  predicted protein  60.8 
 
 
335 aa  394  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.746499 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0513  AAA ATPase  41.88 
 
 
322 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.203614 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0528  AAA ATPase  40.91 
 
 
318 aa  214  3.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.162948 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3621  AAA ATPase  36.42 
 
 
386 aa  193  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2960  AAA ATPase  35.42 
 
 
322 aa  160  8e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4046  sporulation stage III protein AA  28.57 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3946  stage III sporulation protein AA  29.17 
 
 
308 aa  84  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4323  stage III sporulation protein AA  28.33 
 
 
308 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4266  stage III sporulation protein AA  28 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4097  stage III sporulation protein AA  28.79 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3935  stage III sporulation protein AA  28.79 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4417  stage III sporulation protein AA  28.79 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4213  stage III sporulation protein AA  28.79 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0252456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4303  stage III sporulation protein AA  27.91 
 
 
308 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0931  stage III sporulation protein AA  28.41 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.719213 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2887  sporulation stage III protein AA  27.18 
 
 
307 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1525  AAA ATPase  26.62 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1713  stage III sporulation protein AA  31.52 
 
 
322 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1801  stage III sporulation protein AA  27.14 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2087  stage III sporulation protein AA  26.77 
 
 
294 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.963065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0235  stage III sporulation protein AA  33.85 
 
 
306 aa  63.5  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06170  Sporulation stage III protein AA  33.33 
 
 
316 aa  62.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1536  hypothetical protein  27.9 
 
 
350 aa  61.6  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.127679 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1056  hypothetical protein  31.72 
 
 
337 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0117191  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1916  stage III sporulation protein AA  25.8 
 
 
331 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2336  stage III sporulation protein AA  25.44 
 
 
308 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0845  stage III sporulation protein spoIIIAA  29.68 
 
 
336 aa  57.4  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000346466  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1007  AAA ATPase  30.19 
 
 
332 aa  54.3  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2524  stage III sporulation protein AA  27.95 
 
 
322 aa  52.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0550  stage III sporulation protein spoIIIAA  27.23 
 
 
313 aa  50.4  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.852342  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3516  stage III sporulation protein AA  29.88 
 
 
361 aa  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00709627  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0990  AAA ATPase  24.72 
 
 
313 aa  49.3  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1329  type II secretion system protein E  26 
 
 
342 aa  48.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.336325  normal  0.041455 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1793  stage III sporulation protein AA  29.41 
 
 
334 aa  47  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2611  stage III sporulation protein AA  29.93 
 
 
345 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1538  twitching motility protein PilU  29.27 
 
 
372 aa  45.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0266  ATPase central domain-containing protein  44.44 
 
 
277 aa  43.9  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.614656  hitchhiker  0.00000478059 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2133  type II secretion system protein E  28.81 
 
 
343 aa  43.5  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.363948  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>