62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3015 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4555  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  64.53 
 
 		 605 aa  750    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2072  single-stranded nucleic acid-binding R3H domain-containing protein  68.07 
 
 		 579 aa  808    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0126  single-stranded nucleic acid binding R3H  68.91 
 
 		 579 aa  802    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0600  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  67.53 
 
 		 584 aa  777    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1230  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  66.05 
 
 		 602 aa  768    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.479745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0625  single-stranded nucleic acid binding R3H  66.16 
 
 		 588 aa  766    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.57022  normal  0.210072 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3015  single-stranded nucleic acid binding R3H  100 
 
 		 590 aa  1198    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0100908 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1201  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  66.05 
 
 		 602 aa  768    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0379  ATPase  52 
 
 		 546 aa  547  1e-154  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.788965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1951  ATPase  51.56 
 
 		 539 aa  542  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22991  AAA ATPase superfamily protein  51.47 
 
 		 545 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0499  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  47.87 
 
 		 565 aa  514  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000861102  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2939  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  48.4 
 
 		 540 aa  513  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  normal  0.269188 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0684  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  48.3 
 
 		 551 aa  510  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0777  R3H domain-containing protein  46.84 
 
 		 509 aa  476  1e-133  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.191929  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_683  R3H domain protein  46.84 
 
 		 537 aa  472  1e-132  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_1953  predicted protein  44.69 
 
 		 552 aa  459  9.999999999999999e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0703  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  66.87 
 
 		 509 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3233  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  65.36 
 
 		 538 aa  435  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.384079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3721  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  66.06 
 
 		 538 aa  434  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059695 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4406  predicted protein  62.42 
 
 		 335 aa  421  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.746499 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0786  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  64.72 
 
 		 515 aa  421  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0872  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  63.84 
 
 		 515 aa  421  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.559562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0032  AAA ATPase  60.98 
 
 		 445 aa  408  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2975  single-stranded nucleic acid binding R3H  65.27 
 
 		 496 aa  393  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38424  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0513  AAA ATPase  39.23 
 
 		 322 aa  209  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203614 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0528  AAA ATPase  39.74 
 
 		 318 aa  208  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.162948 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3621  AAA ATPase  35.29 
 
 		 386 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2960  AAA ATPase  36.27 
 
 		 322 aa  163  7e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2087  stage III sporulation protein AA  28.31 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.963065  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1801  stage III sporulation protein AA  27.94 
 
 		 294 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1525  AAA ATPase  30.06 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1713  stage III sporulation protein AA  29.19 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4323  stage III sporulation protein AA  24.82 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4266  stage III sporulation protein AA  24.82 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4303  stage III sporulation protein AA  24.45 
 
 		 308 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3946  stage III sporulation protein AA  24.35 
 
 		 308 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0931  stage III sporulation protein AA  24.45 
 
 		 308 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.719213 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2887  sporulation stage III protein AA  25.46 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4097  stage III sporulation protein AA  23.99 
 
 		 308 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3935  stage III sporulation protein AA  23.99 
 
 		 308 aa  66.6  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4417  stage III sporulation protein AA  23.99 
 
 		 308 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4213  stage III sporulation protein AA  23.99 
 
 		 308 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0252456 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0845  stage III sporulation protein spoIIIAA  30.13 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000346466  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4046  sporulation stage III protein AA  24.35 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0235  stage III sporulation protein AA  30.83 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06170  Sporulation stage III protein AA  30.3 
 
 		 316 aa  63.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1916  stage III sporulation protein AA  30.67 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2336  stage III sporulation protein AA  26.99 
 
 		 308 aa  59.7  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1536  hypothetical protein  30.25 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.127679 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1056  hypothetical protein  30.81 
 
 		 337 aa  57  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0117191  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0990  AAA ATPase  29.1 
 
 		 313 aa  53.9  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0550  stage III sporulation protein spoIIIAA  28.57 
 
 		 313 aa  51.6  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.852342  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2611  stage III sporulation protein AA  27.01 
 
 		 345 aa  51.6  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2524  stage III sporulation protein AA  28.68 
 
 		 322 aa  50.8  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1007  AAA ATPase  28.91 
 
 		 332 aa  50.8  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3516  stage III sporulation protein AA  28.21 
 
 		 361 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00709627  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1329  type II secretion system protein E  26.22 
 
 		 342 aa  46.6  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.336325  normal  0.041455 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2133  type II secretion system protein E  29.85 
 
 		 343 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.363948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0517  AAA ATPase, central region:ATPase  33.67 
 
 		 301 aa  45.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1686  stage III sporulation protein AA  29.56 
 
 		 323 aa  44.7  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2157  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  43.33 
 
 		 199 aa  44.3  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>