59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2524 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2524  stage III sporulation protein AA  100 
 
 
322 aa  655    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1916  stage III sporulation protein AA  46.39 
 
 
331 aa  294  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1056  hypothetical protein  45.05 
 
 
337 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0117191  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1007  AAA ATPase  43.87 
 
 
332 aa  284  1.0000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1525  AAA ATPase  46.54 
 
 
332 aa  281  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0845  stage III sporulation protein spoIIIAA  42.86 
 
 
336 aa  280  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000346466  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1536  hypothetical protein  43.55 
 
 
350 aa  273  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.127679 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2611  stage III sporulation protein AA  45.58 
 
 
345 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3516  stage III sporulation protein AA  45.77 
 
 
361 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00709627  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0550  stage III sporulation protein spoIIIAA  42.66 
 
 
313 aa  255  6e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.852342  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1686  stage III sporulation protein AA  40.58 
 
 
323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1801  stage III sporulation protein AA  41.52 
 
 
294 aa  253  3e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2087  stage III sporulation protein AA  41.18 
 
 
294 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.963065  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06170  Sporulation stage III protein AA  43.77 
 
 
316 aa  249  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0235  stage III sporulation protein AA  45.21 
 
 
306 aa  242  7e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2336  stage III sporulation protein AA  43.69 
 
 
308 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4046  sporulation stage III protein AA  40.84 
 
 
308 aa  230  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3946  stage III sporulation protein AA  38.85 
 
 
308 aa  229  5e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2887  sporulation stage III protein AA  39.49 
 
 
307 aa  229  5e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4417  stage III sporulation protein AA  38.54 
 
 
308 aa  229  7e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4213  stage III sporulation protein AA  38.54 
 
 
308 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0252456 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3935  stage III sporulation protein AA  38.54 
 
 
308 aa  229  7e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4097  stage III sporulation protein AA  38.54 
 
 
308 aa  229  7e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4323  stage III sporulation protein AA  38.85 
 
 
308 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4266  stage III sporulation protein AA  39.23 
 
 
308 aa  227  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1713  stage III sporulation protein AA  37.59 
 
 
322 aa  227  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0931  stage III sporulation protein AA  41.44 
 
 
308 aa  225  7e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.719213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4303  stage III sporulation protein AA  41.44 
 
 
308 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1793  stage III sporulation protein AA  39.93 
 
 
334 aa  224  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0990  AAA ATPase  36.21 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3621  AAA ATPase  34.67 
 
 
386 aa  87  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0528  AAA ATPase  33.33 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.162948 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0513  AAA ATPase  33.33 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.203614 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0032  AAA ATPase  30.43 
 
 
445 aa  62.4  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0684  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  29.27 
 
 
551 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_1953  predicted protein  28.31 
 
 
552 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0499  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  28.05 
 
 
565 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000861102  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2960  AAA ATPase  27.39 
 
 
322 aa  53.1  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0872  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  31.08 
 
 
515 aa  52.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.559562  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2939  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  27.95 
 
 
540 aa  52.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  normal  0.269188 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2975  single-stranded nucleic acid binding R3H  27.27 
 
 
496 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.38424  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3015  single-stranded nucleic acid binding R3H  28.68 
 
 
590 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0100908 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0703  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  26.67 
 
 
509 aa  50.8  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0786  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  26.71 
 
 
515 aa  50.1  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3721  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  29.73 
 
 
538 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059695 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3233  single-stranded nucleic acid binding R3H domain-containing protein  29.73 
 
 
538 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.384079  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22991  AAA ATPase superfamily protein  27.21 
 
 
545 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_683  R3H domain protein  26.06 
 
 
537 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0777  R3H domain-containing protein  26.06 
 
 
509 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.191929  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0126  single-stranded nucleic acid binding R3H  22.52 
 
 
579 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4555  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  28.15 
 
 
605 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1230  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  25.74 
 
 
602 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.479745  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1951  ATPase  27.03 
 
 
539 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1201  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  25.74 
 
 
602 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4406  predicted protein  25 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.746499 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0379  ATPase  28.15 
 
 
546 aa  43.9  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.788965  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0600  single-stranded nucleic acid binding R3H domain protein  27.41 
 
 
584 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767642  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0625  single-stranded nucleic acid binding R3H  26.47 
 
 
588 aa  43.1  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.57022  normal  0.210072 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2072  single-stranded nucleic acid-binding R3H domain-containing protein  22.91 
 
 
579 aa  43.1  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>